Хулагу прожил семь лет после захвата Багдада, в течение которых он вторгся в Сирию и захватил Алеппо. Однако ему было нанесено решающее поражение в битве при Айн-Джалуте армией мамлюков под командованием великого Бейбарса аль-Бундукдари. Этот успех был первой победой мусульман над монголами с тех пор, как эти языческие орды начали свое победоносное вторжение в Центральную Азию и Персию. Ее военное значение усилил тот факт, что от разрушения был спасен Каир – драгоценный и почти последний из оставшихся центр мусульманской культуры. Стоит отметить, что из крупных городов Персии спасся лишь Шираз благодаря своевременной капитуляции, как написал поэт Саади в панегирике своему покровителю Сааду ибн Занджи: «Александр с помощью стены из меди и камня сузил путь Гога из мира. Преграда Гогу язычества – из золота, а не из меди, как стена Александра»
В 1262 г. началась война между Хулагу и его двоюродным братом Берке – ханом Золотой Орды за право владеть провинцией, пограничной для обоих царств. В сражении, которое произошло в провинции Ширван, обе стороны понесли огромные потери, но в конце концов Хулагу одержал победу. Однако позднее Берке собрал своих людей и, неожиданно напав на войско под командованием Абаки – сына ильхана, разгромил его с еще большим кровопролитием. Чрезвычайно интересно отметить, что эта война не только упоминается старшими представителями семьи Марко Поло, но и так как она помешала им возвратиться к побережью Черного моря, то стала непосредственной причиной их смелого путешествия на восток в Центральную Азию и Китай.
Старшая жена Хулагу Докуз-хатун была из племени кераитов, исповедовала христианство и использовала свое сильное влияние для защиты своих единоверцев во время разграбления Багдада. Весть об этом и другие слухи дошли до Рима, и папа римский написал ильхану письмо, выразив в нем свою радость по поводу того, что тот склонен принять христианскую веру.
Хулагу сделал своей столицей город Марагху. Будучи рьяным поклонником астрологии, он построил знаменитую обсерваторию, которой руководил астроном и философ Насир ад-Дин Туси; ее развалины и по сей день привлекают к себе путешественников. Хулагу умер в 1265 г. и был похоронен на острове Тала, находящемся на озере Урмия, где он хранил накопленные богатства ассасинов и халифов.
Старший сын Хулагу Абага беспрепятственно унаследовал трон своего отца, но не получил в полном объеме царскую власть, пока его кандидатура не была утверждена Хубилаем. Одним из его первых деяний была женитьба на внебрачной дочери императора Михаила Палеолога по имени Мария, которая была послана в качестве невесты Хулагу, но передана уже его преемнику.
Едва новый ильхан взял в свои руки бразды правления, как монголы из Золотой Орды вторглись в Армению. В долине реки Куры состоялось отчаянное сражение, но Золотая Орда в конечном счете отступила, и Абага построил за Курой линию укреплений, в которых оставил свои гарнизоны.
Феодальные распри между различными монгольскими правителями привели к еще одной войне. В 1265 г. Хубилай подарил Транс-оксиану Бораку – сыну Чагатая, с условием, что тот нападет на внука Угэдея Кайду, который отказался признать его каганом. Эти два лидера со временем заключили друг с другом мир и решили совместными силами вторгнуться в Хорасан.
Абага вышел навстречу их войску и, достигнув провинции Бадгис, расположенной севернее Герата, предложил Бораку, который тем временем занимался грабежами земель до самого Нишапура, заключить с ним мирный договор при условии назначения его правителем Газни и Кермана. Борак отверг эти предложения, после чего Абага инсценировал бегство, чтобы заманить за собой своего противника и добиться решающего результата. Абага остановился у Герата, и в последовавшем бою его левый фланг был смят, но правый фланг и центр под командованием Субэдэя одержали победу. Поэт того времени написал:
Борак, который упал с коня во время сражения, получил тяжелые ранения и чуть было не попал в плен. Он добрался до Бухары, но умер несколько месяцев спустя. После своей победы Абага разорил Хорезм и Трансоксиану с целью защитить Хорасан от другого вторжения. Эти провинции, которые начали восстанавливаться после разрушительного вторжения Чингисхана, снова были опустошены и обезлюдели.