25 июля 1687 г. гетманом Левобережной Украины был избран Иван Мазепа, один из величайших государственных деятелей Украины. На старшинской раде были утверждены так называемые Коломацкие статьи, которые уже традиционно принимались при избрании нового гетмана. Статьи запрещали Украине торговать с Крымом, нарушали ее финансовую систему. Статья 19 без всяких предостережений провозглашала Украину частью Московского государства.
В царствование Петра I Украинское государство еще больше ограничивается в автономии. В 1706 г. по указу царя казацкое войско переходит под командование Москвы. Петр I принуждал казаков принимать участие во всех войнах, которые он проводил. Военные походы, принудительные работы забирали жизнь многих украинцев. Петр I нанес сокрушительный удар по экономике Украины, фактически отменив свободную торговлю. Он начал проводить колониальную политику и в отношении культуры Украины. Отдельным указом 1709 г. были запрещены украинский язык, национальное книгоиздание. В 1720 г. Петр I издал указ киевскому губернскому князю Голицыну, чтобы “...во всех монастырях, остающихся в Российском государстве, осмотреть и забрать древние жалованные грамоты и другие куртиозные письма оригинальные, а также книги исторические, рукописные и печатные”.
При Петре I Украина предприняла последнюю попытку восстановить государственную самостоятельность. Эта попытка связана с именем Ивана Мазепы, который за двадцатилетнее гетманство приложил много усилий для того, чтобы вывести Украину из “руины”, прекратить здесь политический беспорядок.
Как пылкий патриот Украины Мазепа, проявляя лояльное отношение к царю, сохранял надежду на освобождение Украины и создание самостоятельного Украинского государства. В то же время Петр I хотел заменить казачество рекрутчиной, а Украину превратить в неотъемлемую часть России. Воспользовавшись шведско-российской войной, Мазепа при поддержке генеральной старшины и большинства полковников заключил со шведским королем соглашение, по которому “Украина по обеим сторонам Днепра с Войском Запорожским и народом малороссийским должна быть на вечные времена свободная от всякого чужого господства”. Соглашение гарантировало также абсолютное невмешательство любого государства во внутренние дела Украины, неприкосновенность ее границ.
Разгром шведских войск под Полтавой в 1709 г. перечеркнул стремление Ивана Мазепы освободить Украину. С частью верных казаков он вынужден был спасать себя и своих сторонников за Дунаем в турецких владениях, где вскоре и умер.
В 1710 г. на старшинской раде в Бендерах гетманом в изгнании был избран Пилил Орлик, который много сделал для утверждения идеи независимой, самостоятельной Украины. В частности, при его участии в 1710 г. была подготовлена и принята Конституция Украинского государства.
Еще в 1708 г., после перехода Мазепы на сторону Карла XII, гетманом Левобережья был избран Иван Скоропадский. После его смерти в 1722 г. Петр I вообще запретил выборы нового гетмана. Гетманство было восстановлено после смерти Петра I в 1727 г. Царское правительство пошло на этот шаг, чтобы получить поддержку со стороны казацкой старшины в связи с обострением русско-турецких отношений.
Избранный гетманом Даниил Апостол был выдающимся государственным и военным деятелем. 22 августа 1728 г. Даниил Апостол обратился к царскому правительству с просьбой утвердить “гетманские статьи” . В ответ на это он получает “Решительные статьи”, в которых вовсе не упоминается о договоре Украины с Москвой 1654 г. Эти статьи имели форму приказа царского правительства гетману. В целом пункты статей Даниила Апостола были выдержаны в духе подтверждения автономии украинской государственности. Россия ответила на них целой системой ограничений и ударом именно по этой государственности.
После смерти Даниила Апостола гетманство снова ликвидируется. Для управления делами в Украине была создана II Малороссийская коллегия, которая получила название “Правление гетманского уряда”.