С конца 2006 г. оживилась и так называемая «внесистемная оппозиция» (политические партии и движения не представленные в Государственной Думе). По ряду городов России прошли «Марши несогласных». Их целью было объединить оппозиционные силы различного толка в противостоянии с официальными властями.
В конце второго президентского срока Путина в обществе и СМИ стал активно обсуждаться вопрос о возможности продления его президентских полномочий на третий срок. Однако по Конституции РФ должность Президента одно лицо не может занимать более двух сроков подряд. Сам Президент не раз заявлял, что он не пойдёт на нарушение Конституции.
В декабре 2007 г. убедительную победу на выборах в Государственную Думу 5-го созыва одержала партия «Единая Россия». Незадолго до начала предвыборной кампании партийный список «единороссов» возглавил В.В. Путин, что и предопределило успех «Единой России». Через несколько дней после выборов в Государственную Думу на встрече с Путиным лидеры партий «Единая Россия», «Справедливая Россия» и двух непарламентских партий «Гражданская сила» и «Аграрная партия» выдвинули кандидатом на пост Президента РФ Д.А. Медведева, поддержанного Путиным. В свою очередь Медведев заявил, что в случае своего избрания Президентом России на должность Председателя Правительства назначит В.В. Путина с целью продолжить политический курс действующего Президента.
2 марта 2008 г. на выборах Д. Медведев, набрав более 70 % голосов избирателей, стал Президентом России. В силу сложившейся политической ситуации в период президенства Медведева возникла необычная для России конструкция власти, получившая в СМИ название «тандем» – Президента Д. Медведева и Председателя Правительства В.Путина. Для большинства населения России, в силу политического веса, авторитета, опыта и просто возраста, было понятно, кто в этом тандеме играл главную роль. И всё-таки Д. Медведеву, не выходя за рамки продолжавшегося политического курса, удалось обозначить тренды во многих сферах жизни, правильно диагностировать проблемы, стоявшие перед страной: невысокое качество законов, отсутствие независимой судебной системы, коррупция, неуважение к частной собственности, неразвитая инфраструктура, отсутствие стимулов к инновациям, изношенное ЖКХ, высокие цены на жильё, низкий уровень медицины и образования. Д. Медведев также обозначил проблемы обратной связи между обществом и властью.
В первый год президенства Медведеву пришлось принимать непростые решения о военной операции против Грузии, вторгшейся в Южную Осетию, удержать ситуацию в ходе разразившегося мирового финансового кризиса. Среди наиболее значимых решений, принятых по инициативе Медведева, следует отметить реформу МВД (которая, как утверждают руководители МВД, ещё будет продолжена), смену большой части губернаторов, в том числе мэра Москвы Ю.В. Лужкова, руководителей Татарстана и Башкортостана – М.Ш. Шаймиева и М.Г. Рахимова. Впервые за 15 лет существования, по предложению Медведева была изменена Конституция РФ. В неё были внесены следующие поправки: об увеличении срока президентских полномочий с четырёх до шести лет, депутатов Государственной Думы – с четырёх до пяти лет. Наконец, в последние месяцы нахождения на посту Президента Медведев внёс в Государственную Думу законопроект о возврате отменённых в 2004 г. прямых выборов глав регионов России. Кроме того, был значительно упрощён порядок регистрации политических партий.
В сентябре 2011 г. на съезде «Единой России» глава государства выступил с заявлением, что было бы правильнее, чтобы съезд поддержал В. Путина в качестве кандидата на пост президента страны, а сам он готов работать в правительстве. Тем самым Д.А. Медведев отказался баллотироваться на новый президентский срок.
4 декабря 2011 г.
состоялись очередные выборы в Государственную Думу 6-го созыва. Впервые депутаты избирались сроком на пять лет. По результатам голосования четыре партии преодолели семипроцентный барьер: «Единая Россия» (49,32 % голосов избирателей), Коммунистическая партия Российской Федерации (19,19 %), «Справедливая Россия» (13,24 %) и Либерально-демократическая партия (11,67 %). В сравнении с выборами 2007 г. все партии, прошедшие в Думу, получили больше голосов, за исключением «единороссов» (меньше на 15 %).После выборов в Государственную Думу, в течение декабря 2011 г. – весны 2012 г., по стране прошли массовые выступления протеста. Участники акций заявляли, что выборы прошли с большими нарушениями выборного законодательства и фальсификациями. Основным лозунгом большинства акций стал «За честные выборы!» По разным оценкам, митинг на Болотной площади в Москве в декабре 2011 г. стал самым массовым с начала 90-х годов. Эти выступления, как уже отмечалось выше, привели к возвращению прямых выборов глав регионов России и значительному упрощению регистрации новых политических партий.
Подводя итоги президентства Д.А. Медведева, целый ряд наблюдателей отмечали, что главным результатом его деятельности стало изменение общественного климата.