Обновлению церковной жизни сопутствовало реформирование школьного образования. Компромисс между византийско-славянской образовательной традицией и «латинской наукой» был заложен в Острожской школе. По ее следам пошла самая авторитетная из братских школ — Львовская. В 1631 г. П. Могила открыл коллегиум при Киево-Печерском монастыре, где, кроме грамматики, поэтики и риторики, изучались «высшие науки» — философия и богословие. Распорядок учебы, структура и последовательность дисциплин, методы преподавания были организованы по образцу протестантских и иезуитских коллегиумов.
К середине XVII в. из 32 иезуитских коллегиумов Речи Посполитой более трети находились на территории Украины. Первый был открыт в Ярославе в 1571 г., следующий — во Львове в 1606 г. Из-за отсутствия квалифицированных преподавателей в Луцком (1609), Каменец-Подольском (1610), Острожском (1626), Перемышленском (1628) коллегиумах преподавание философии и богословия велось нерегулярно. Ряд коллегиумов обеспечивал только средний уровень образования, где преподавание завершалось поэтикой и риторикой: в Фастове (1625), Киеве (1647), Виннице (1630), Баре (1636), Овруче (1646). Низшие «грамматические» классы существовали в Новгороде-Северском (1638). Через иезуитские школы с конца XVI до середины XVII в. прошло 2,5—3 тыс. юношей.
Оппоненты иезуитов — протестанты — также создали собственную сеть школ, среди которых выделялась кальвинистская гимназия в Дубецке (1560). Кальвинистские школы среднего уровня, т. е. с классами поэтики и риторики, существовали в м. Панивцы недалеко от Каменец-Подольского (1590) и в Крылове (1593—1612). На Волыни и на западе Киевщины было организовано несколько учебных заведений социан. А в 1638—1658 гг. в г. Киселин, принадлежавшем волынскому магнату Юрию Чапличу, действовала социанская Киселинская академия.
Униаты также имели свои школы, начало организации которых положил митрополит Ипатий Потей. Он основал на собственные средства в 1609 г. школу-гимназию во Владимире-Волынском. В 1639 г. школа «греческих и латинских наук» была открыта в Холме. Ее первым ректором стал известный церковный писатель Яков Суша. Авторитет этой школы чуть было не позволил превратить ее в униатскую академию.
Среди образовательных учреждений высшего типа особую роль в просвещении украинской молодежи сыграла католическая Замойская академия, открытая на средства великого коронного гетмана Яна Замойского в центре его владений на Холмщине.
Образование во второй половине XVII — XVIII в.
Гетманы Войска Запорожского Б. Хмельницкий, И. Выговский, И. Мазепа прикладывали значительные усилия для развития образования. Были открыты школы в Нежинском, Лубенском, Черниговском, Полтавском, Переяславском, Прилукском, Миргородском полках. Школьное образование охватило все слои населения, включая женщин (на 1099 поселений было 866 школ). Оно стимулировало создание различных учебных пособий.
Во второй половине XVII — середине XVIII в. значительное влияние на развитие науки и образования в Украине имел Киево-Могилянский коллегиум, преобразованный указом Петра I в 1701 г. в академию. Обучение в академии носило не только духовный, но и светский характер: преподавали математику, медицину, астрономию, изучали архитектуру и живопись. Киево-Могилянский коллегиум воспитал многих известных философов, религиозных деятелей и литераторов. Так, его закончил архимандрит Иоанникий Галятовский, трактат которого «Наука или способ составления проповедей» (1659) оказал большое влияние на развитие церковно-ораторского искусства не только в Украине, но и в России.
Выпускник, а позднее ректор коллегиума Иннокентий Гизель заслужил от современников название «столпа и подпоры церкви Божией». В 1669 г. он издал сочинение «Мир с Богом человеку», посвященное проблемам греха и покаяния. В 1674 г. появился его «Синопсис», который стал первым учебником по истории России.
В первой половине XVIII в. Киев превратился в центр образования не только Украины. В академии могли учиться представители всех социальных слоев населения. Из ее стен вышло немало выдающихся деятелей Молдовы, Болгарии, Черногории, Сербии и других стран. Академию закончили ученые, религиозные и политические деятели: И. Выговский, И. Мазепа, П. Орлик, П. Полуботок, Ф. Прокопович, С. Яворский, Г. Сковорода, Н. Н. и Д. Н. Бантыш-Каменские, А. А. Безбородько. Воспитанники академии оказали существенное влияние на развитие образования в России. По образцу Киевской академии были основаны коллегиумы в Чернигове (1700), Харькове (1721), Переяславе (1738). Расцвет академии продолжался до 60-х гг. XVIII в., но затем она была реформирована в высшую духовную школу.