Высшим исполнительным органом страны был Совет Министров СССР.
В 1978 г. в Совете Министров появился Президиум, что было вызвано прежде всего серьезным увеличением его численности и возросшей сложностью управления. В 1964 г. председателем Совета Министров был назначен А. Н. Косыгин, который находился на этом посту до своей смерти в 1980 г. С 1980 г. по 1985 г. председателем Совета Министров СССР был Н. А. Тихонов. Отличительной особенностью правительства в этот период было интенсивное разбухание аппарата. Новые министерства и ведомства появлялись почти каждый год. Если в октябре 1965 г. было 29 общесоюзных и союзно-республиканских министерств, то уже в 1975 г. количество их возросло до 135, а к середине 80-х годов министерств и ведомств министерского уровня насчитывалось до 160. Увеличение аппарата управления привело к тому, что он стал самым большим (за исключением китайского) бюрократическим аппаратом в мире. К середине 80-х годов в нем работало около 18 млн. человек, что составляло 1/7 всего трудоспособного населения СССР. Обществу стало не хватать средств, чтобы содержать такой бюрократический аппарат.Наиболее серьезным структурным изменениям была подвергнута в конце 70-х годов та часть административного аппарата, которая была связана с управлением народным хозяйством. В феврале 1979 г. Совет Министров СССР утвердил положение о производственном объединении в сельском хозяйстве, включавшим в себя агропромышленные предприятия и объединения.
Реально они стали функционировать с 1982 г., после очередного постановления ЦК КПСС и Совета Министров. Суть изменений заключалась в том, чтобы объединить промышленные и сельские организации и предприятия, повысить тем самым производительность труда в сельском хозяйстве и уменьшить ведомственную разобщенность. Агропромышленные объединения напоминали совнархозы, которые ввел Хрущев. Причиной начала очередного эксперимента в сельском хозяйстве было перманентное кризисное его состояние, неспособность прокормить население страны. Как практически все эксперименты периода «застоя», агропромышленные объединения очень быстро показали свою неэффективность и к 1988 г. практически прекратили свое существование.Последнюю попытку оживить работу административного аппарата в рассматриваемый период предпринял Ю. В. Андропов, который пришел к власти в ноябре 1982 г. после смерти Л. И. Брежнева (ноябрь 1982 — Генеральный секретаре ЦК КПСС, июнь 1983 — председатель Президиума Верховного Совета СССР). Андропов пытался придать эффективность партийно-административному бюрократическому аппарату без каких-либо структурных изменений, путем усиления репрессивных органов, прежде всего КГБ. Реальных результатов добиться он не смог, так как партийно-государственный аппарат не собирался расставаться со своими привилегиями. В то же время он нанес определенный урон конкурирующей группировке высших госаппаратчиков, что привело к ослаблению сплоченности и единства последних. В феврале 1984 г. Андропов умер, так и не завершив начавшуюся чистку.
В 1965–1985 гг. КПСС по-прежнему была «ядром политической системы советского общества». В эти годы происходил процесс централизации партийной организации, усиления власти партократии.
Все демократические начинания Хрущева уже в 60-е годы были отменены. В 1965 г. ликвидировано разделение на городские и сельские комитеты партии, отменено положение, согласно которому нельзя было занимать любой административный пост более двух сроков. Постепенно «демократический запал», который получило общество в предыдущий период, был сведен на нет. Партийные собрания, конференции и съезды стали все больше напоминать спектакли, на которых «единогласно» принимались решения, заранее согласованные в вышестоящих инстанциях.В течение 70-х годов практически полностью исчезло такое понятие, как демократические выборы. Выборы в партийные органы представляли собой утверждение спущенных сверху кандидатур. Причем повсеместно была принята практика выдвижения одного, кандидата на один пост, который мог не пройти только в том случае, если против него проголосовало бы 50 % членов партийной организации, что было в принципе невозможно. Исчезновение даже внешних признаков демократии приводило к усилению пассивности как рядовых членов партии, так и просто граждан страны. Хотя в голосованиях и на выборах участвовало, по официальным данным, 90 % и более членов партии, как правило, эти цифры были фальсифицированы и искусственно завышены.