От соединения с Малороссией для Москвы если и были какие-то выгоды, то уж, конечно, не военные и политические, а скорее культурные. Уже в 1648 году печатный двор в Москве издал церковно-славянскую грамматику Мелентия Смотрицкого. Ртищев выписал из Малороссии и поселил в Андреевском монастыре под Москвой 30 учёных монахов, которые должны были заниматься переводами с иностранных языков и обучением желающих. Но это просвещение имело и оборотную сторону. Влияние «латинян», как их называли в народе (и которых не любили после великой Смуты), позднее приведёт к церковному расколу. Вообще, соединение двух народов под одной крышей после того, как они были разделены судьбой более трёх веков, проходило с великими трудностями, обидами, болью и долгими распрями.
К примеру, стрельцы из России и запорожцы сразу невзлюбили друг друга, участвуя в общих походах. Вот как пишет автор «Истории Русов»:
Знаменитый Ордин-Нащёкин, вершитель внешней политики при Алексее Михайловиче, открыто высказывался за лишение Украины русского подданства. Своими непрестанными изменами и путчами казаки ему опротивели. Только глубокая религиозность царя Алексея Михайловича, приходившего в ужас при мысли об отдаче православного народа католикам или магометанам, не позволяла распространять подобных тенденций при дворе.
Автор «Истории Русов» не пожалел своих сил, отыскивая краски для чернения русских людей. В его интерпретации установление царского контроля воевод смахивает на нашествие монголо-татар: «
В действительности мещане, мужики и простые казаки выражали царскому стряпчему Рогозину, когда он ехал к гетману Выговскому, желание полной замены казачьей администрации царской. Наказной войт в Дубнах Котляр говорил: «Мы все были рады, когда нам сказали, что будут царские воеводы, бояре и ратные люди; мы, мещане, с казаками и чернью заодно. Будет у нас в Николин день ярмарка, и мы станем советоваться, чтоб послать к великому государю бить челом, чтоб у нас были воеводы». Нежинский протопоп Филимонов писал боярину Ртищеву: «Изволь, милостивый пан, советовать царю, чтоб не откладывая взял здешние края и города черкасские на себя и своих воевод поставил, потому что все желают одного подлинного государя, чтоб было на кого надеяться. Мы все желаем и просим, чтоб был у нас один Господь на небе и один царь на земле. Противятся этому некоторые старшие для своей прибыли: возлюбивши власть, не хотят от неё отступиться».