Габсбургский монарх Леопольд I, «маленький император в красных чулках», избрание которого на пост императора в 1658 г. чуть было не сорвали интриги Мазарини, очень быстро положил конец расширению французского влияния в Восточной Европе, опасаясь, что Франция снова объединится со Швецией. Помощь французских войск, которые помогли Леопольду I отразить вторжение турок в его наследственные владения, разгромив их в Сент-Готтардской битве 1 августа 1664 г., не помешали ему послать в Польшу своих людей. Они должны были вызвать у поляков возмущение проектом, который позволил бы правившему королю руководить выборами своего преемника. Однако мятеж нового великого гетмана Любомирского против французской партии при дворе провалился, и к ней присоединился Ян Собеский, женатый на француженке Марии д’Аргенской, получив знаки гетманского достоинства.
На восточных границах Польши династический кризис сильно ослабил ее позиции на переговорах в Дуровичах и военную мощь на Украине. В Киеве появились русские полки и с помощью казаков Брюховецкого заставили поляков и их сторонников убраться с Украины.
Теперь уже ни русские, ни поляки, много лет воевавшие друг с другом, не хотели продолжать борьбу. Летом 1665 г. Брюховецкий приехал в Москву, чтобы «смиренно склониться перед царем от имени всех украинских городов». Гетмана приняли с почестями и, несмотря на его низкое происхождение, женили на дочери гордых Шереметевых. Некоторые казацкие старшины и полковники из свиты гетмана, которые, по словам автора того времени, «образовали многочисленную свиту», тоже вступили в браки с дочерьми знатных московских семей. Весь сентябрь того же года в Москве справляли свадьбы и веселились. Результатом всех этих событий стали дополнения к Мартовскому соглашению 1654 г., обнародованные 11 октября 1665 г. Согласно им, «вся земля принадлежит царю, а не гетману», поэтому все налоги, которые платят горожане и крестьяне, должны поступать в царскую казну, а равно и «все налоги с таверн, где пьют спиртное», налоги с мельниц, «медовые дани» и пошлины, взимаемые с иноземных купцов. Были подтверждены права казаков на самоуправление и избрание гетмана и чиновников, но для сбора налогов в царскую казну во многие украинские города посылались московские воеводы вместе с многочисленными служащими и войсками, становившимися в городах на постой.
Во многих отношениях «дополнения» просто разъясняли условия договора 1654 г. и приводили в действие первоначальную базу, на которой он был заключен. Однако украинцы восприняли весть о «соглашении Брюховецкого» как доказательство его измены. Содержание договора 1654 г. было известно лишь небольшому числу казаков, а из тех, кто это знал, многие забыли или хотели забыть его условия. Кроме того, Москва нажила себе опасных врагов в лице высших иерархов украинской церкви, которых возмутило прошение Брюховецкого о том, чтобы киевского митрополита назначала Москва.
В первые месяцы 1666 г. весть об уступках, вырванных у Брюховецкого в Москве, разнеслась по всей Украине. Дурные слухи «подкрепил» приезд воевод, которые обосновались не только в Киеве, Переяславе, Чернигове и Нежине, но и во многих других городах. Появившиеся там чиновники «собирали налоги с таким рвением, что от их жадных глаз не могла ускользнуть ни единая копейка». Тех, кто не платил подати, жестоко наказывали. Как несколько наивно отметил один из украинских историков, «это нововведение, возможно привычное в других землях, в нашей показалось жестоким, пагубным и невыносимым».
Установить порядок на Украине оказалось непростым делом. Епископ Мефодий в своих проповедях призывал людей к восстанию против Брюховецкого, а значит, и против Москвы. Дорошенко, контролировавший большую часть земель в Правобережной Украине, перешел на левый берег Днепра, взял Переяслав, где убили московского чиновника, и завладел Золотоношей, где были преданы смерти воевода князь Щербатов и многие московиты. Все Левобережье охватило восстание; Нежин и города Полтавщины признали власть Дорошенко. Повсюду убивали или изгоняли русских чиновников. Даже сохранявшая ранее верность Москве Запорожская Сечь изгнала «вспомогательный» стрелецкий полк, там расквартированный, а русского посла Ладыженского, возвращавшегося домой из Крыма, запорожцы бросили в Днепр.
Возобновление анархии на Украине заставило наконец московское правительство заключить мир с поляками на условиях раздела Украины, долгая борьба за подчинение которой истощила силы обеих стран.