Ираклию было около 36 лет; светловолосый, широкоплечий, он, должно быть, казался людям полубогом, когда вышел из дворца под руку с молодой женой. И все же многие из числа его подданных опасались, что он станет последним императором Византии, так как никому из его предшественников империя не доставалась в столь отчаянном положении. На западе авары и славяне захватили Балканы; на востоке, сразу за Босфором, из Халкидона были ясно видны сигнальные огни персов. Правда, Феодосиевы стены находились в хорошем состоянии, а у персов не было кораблей, чтобы переправиться через пролив; но, хотя столица была в безопасности, провинции слабели. Через год после воцарения Ираклия персидский военачальник Шахрвараз захватил Антиохию. В 613 году он присовокупил к ней Дамаск, а в 614-м – Иерусалим, где не оставил в живых почти никого из христиан. Храм Гроба Господня сожгли до основания, как и большинство других христианских храмов; Крест Господень, а также другие связанные с распятием реликвии, в том числе копье Лонгина и губку, захватили и увезли в Ктесифон. Трудно представить себе более явный знак божественного недовольства. После этого великий шах обратил свое внимание на Египет, и вскоре главный источник имперских запасов зерна превратился в персидскую провинцию. За этим последовали голод и бубонная чума.
Ираклий принялся за работу прямо в день коронации. Первой задачей была подготовка и защита оставшихся владений. Восточная Анатолия была потеряна; западную он разделил на четыре части, каждой из которых управлял стратег – военный наместник – и в каждой из которых поселили значительное число потенциальных солдат (стратиотов), дав им неотчуждаемые наделы земли при условии, что военная служба станет их семейной традицией. Эти новые правила заложили основу для появления хорошо обученной местной армии, что стало серьезным улучшением по сравнению с ненадежными иностранными наемниками. Финансовое положение тем временем улучшали через налогообложение, принудительные займы, непомерные штрафы за коррупцию в прошлом и – впервые в истории – крупные пожертвования от православной церкви. Несмотря на то что патриарх Сергий не одобрял личную жизнь императора (после смерти Евдокии в 612 году Ираклий сочетался браком со своей племянницей Мартиной), он без колебаний предоставил в распоряжение государства всю церковную и монастырскую казну.
Политическое положение Ираклия упрочилось благодаря наскоро заключенному соглашению с аварами, и к весне 622 года он был готов к собственной Персидской войне. В пасхальный понедельник он взошел на борт флагманского корабля, став первым после Феодосия Великого императором, который повел свою армию в битву, и направился вдоль побережья Ионического моря к Родосу, а затем на восток вдоль восточного побережья Анатолии к Иссу, где Александр Македонский нанес поражение персам почти за тысячу лет до этого. Там Ираклий провел лето, занимаясь интенсивным обучением войск тактике боя, проверяя подготовку военачальников и тренируя выносливость воинов. Лишь с приближением осени император двинулся на север, и две армии встретились где-то на Каппадокийском нагорье. Ираклий никогда прежде не командовал армией в полевых условиях, однако персы во главе с выдающимся военачальником Шахрваразом были обращены в бегство. После этого Ираклий вернулся в Константинополь, оставив армию зимовать в Понте. На этот раз никто не протестовал – в конце концов, они были воинами Христа и к тому же победителями.