Однако со временем у них самих появились разъяснения и комментарии, причем, собранные все вместе, они по своему объему могли бы соперничать с Талмудом. Вместе с тем надо отметить, что под влиянием рационалистического направления арабской философии мутазилитов караимские идеологи, в частности, призывали к изучению классического языка Священного Писания, полагая, что человеческий язык несовершенен и нуждается в осмыслении. Первое время караимство получило массовое распространение среди евреев Ближнего Востока и Египта. Со временем караимские писатели сформировали свою религиозно-философскую традицию.
Полемика с караимами оказалась весьма полезной для их противников, приверженцев Талмуда, называемых «раввинистами», или «раббанитами». Они успешно восстановили традиции изучения еврейского языка и восприняли идеи сочетания иудейской учености и рационалистической философии, восходящие к воззрениям иудейско-эллинского философа I в. н. э. Филона Александрийского. Особую роль в этом сыграл уроженец Египта Саадия сын Иосифа (892-942). Он настолько прославился своими познаниями, что, вопреки обычаю, будучи уроженцем Египта, то есть иностранцем, был приглашен на должность гаона в Суру. Он возродил стремление согласовать разум и веру, науку и веру. Уже в возрасте 23 лет он написал сочинение против караимов «Опровержение Анана», в котором доказывал необходимость талмудических комментариев к законам Танаха, поскольку многое там изложено неясно, например ничего не говорится о воздаянии после смерти и воскресении мертвых. Поскольку у иудеев арабский язык постепенно стал вытеснять арамейский в качестве разговорного, Саадия перевел на арабский язык Танах и Мишну. Однако самым его главным трудом стал религиозно-философский трактат «Вера и познание»
Труды Саадии и его последователей имели большое значение для укрепления талмудического иудаизма. Постепенно движение караимов идет на убыль. Теперь уже караимы изучают труды раввинистов и многое негласно перенимают. В последующие века между караимами и раввинистами не отмечается серьезных идеологических конфликтов. В дальнейшем караимы переселились в Византию и через принадлежавший этой державе Крым в XIII-XIV вв. попали в Восточную Европу.
Дискуссии между караимами и раввинистами сыграли еще одну положительную роль. Обе стороны привлекали внимание к изучению языка Священного Писания, и особенно еврейской грамматики. И те и другие нуждались в составлении точного, грамматически выверенного текста Священного Писания. Эту задачу выполнили поколения ученых, называемых «масореты» (евр.