Плохая погода в течение нескольких следующих дней сделала невозможными дальнейшие налеты, и вечером 23 января «Илластриес» покинул Мальту. Два дня спустя авианосец пришел в Александрию, откуда отправился в США для капитального ремонта на американских верфях. В ходе налетов на Ла-Валетту «штуки» нанесли серьезные повреждения оборудованию порта и верфи, а также потопили прямым попаданием 500-кг бомбы в машинное отделение английское судно «Эссекс» и повредили легкий крейсер «Перт». Возвращавшиеся в это время в Александрию легкие крейсера «Глостер» и «Саутгемптон» и эсминцы «Дифендер» и «Дайамонд» подверглись атаке Ju 87 из II./StG 2. 12 пикировщиков под командованием капитана Эннеккеруса, сопровождаемые одним «хейнкелем» Не 111, провели бомбардировку, пикируя со стороны солнца, и добились попаданий в оба крейсера. «Глостер» получил попадание в мостик. Бомба пробила несколько палуб, убив девять и ранив 14 моряков, однако, к счастью для англичан, не взорвалась. Последствия попаданий двух бомб в «Саутгемптон» были гораздо трагичнее. Одна из них разрушила офицерскую кают-компанию, а другая — унтер-офицерскую; при этом погибло множество людей, а возникший пожар не удавалось локализовать. Крейсер пришлось оставить и вскоре он затонул. На тот период это был самый большой корабль Ройал Нэви, потопленный «штуками». «Саутгемптон» был новейшим легким крейсером полным водоизмещением 11350 т, вооруженным двенадцатью 152-мм орудиями.
Следующим этапом карьеры Юнкерс Ju 87 были Балканы. Чтобы не дать возможность англичанам создать там базы, угрожающие Италии и нефтяным полям Румынии, 12-я немецкая армия под командованием фельдмаршала Вильгельма Листа, подкрепленная VIII авиакорпусом генерала барона Вольфрама фон Рихтхофена, была передислоцирована на Балканы. VIII авиакорпус насчитывал вначале 274 самолета, в т. ч. 114 Ju 87 В. Накануне начала операции «Марита» (нападение на Грецию и Югославию) в состав Люфтваффе на Балканах входили следующие части пикирующих бомбардировщиков:
в рамках авиакомандования (Fliegerfuhrer) «Грац»: Stab./StG 3 и II./StG 77;
в рамках авиакомандования «Арад»: Stab., I. и III./StG 77;
в рамках VIII авиакорпуса: Stab., I. и III./StG 2, I./StG 3. В ходе операции усилен StG 1.
Операция «Марита» началась 6 апреля 1941 в 05.15. «Штуки» с самого утра приступили к налетам на аэродромы югославских ВВС. Бомбардировали и города Скопье, Стип и Белее. В первый день VIII авиакорпус потерял две «штуки» (одна из них, из 3./StG 2, пилот обер-фельдфебель Герберт Флор, была сбита над Попливистой). Оперировавшие на севере части пикировщиков, входящие в состав 4-го воздушного флота, атаковали в 06.45 столицу Югославии Белград. Первый налет провели 74 Ju 87 из StG 77.