В архивных документах периода осени 1944 г. отсутствуют какие-либо упоминания по поводу «карельского вопроса». В этом контексте вызывает немало сомнений и возражений трактовка Г.Н. Куприяновым о наличии прямой связи «карельского вопроса», поставленного военкором «Правды» М.М. Шуром, с недоказанной попыткой ликвидации Карело-Финской союзной республики в 1944 г. по инициативе командования Карельского фронта. Возможно, учитывая тогдашнюю конъюнктуру (массовые депортации ряда народов), генералы Карельского фронта вынашивали подобную идею, пытаясь добыть веские свидетельства о якобы массовом сотрудничестве представителей финно-угорского населения с финскими оккупационными властями, обосновании слабости партизанского и подпольного движения в Карелии. В этом случае Карелия утратила бы статус республики (не только союзной, но и автономной). Возможно, последствием подобного развития событий могла стать депортация местного карело-финского населения в Сибирь. Представляется, что, защищая карело-финское население от необоснованных обвинений в пособничестве оккупантам в годы войны, Г.Н. Куприянов отстаивал не только интересы республики, но и собственное положение в политической элите. У его бывшего «товарища по Ленинграду» – Штыкова, ставшего на Карельском фронте ярым оппонентом Куприянова, были также и другие интересы. Оставаясь вторым секретарем Ленинградского обкома партии, Т.Ф. Штыков был заинтересован в восполнении территориальных потерь Ленинграда после выделения из Ленинградской области нескольких районов и передачи их в состав Новгородской и Псковской областей. Частично этот вопрос был решен: из Карело-Финской республики передали Ленинградской области территории Выборгского, Кексгольмского и Яскинского районов, города Выборг и Кексгольм.
Версия, изложенная Геннадием Николаевичем Куприяновым, о том, что именно он предотвратил депортацию населения в Карелии в 1944 г., не подтверждается документально. По его утверждению, на заседании Секретариата ЦК ВКП(б) 30 августа 1944 г. было отвергнуто предложение о ликвидации КФССР (НА РК. Ф. Р-3435. Оп. 2. Д. 215. Л. 112; Оп. 1. Д. 116. Л. 520). Первый секретарь ЦК Компартии Карелии утверждал о том, что на заседании Секретариата ЦК, благодаря его усилиям, удалось заблокировать возможную депортацию финно-угорского народа, на которой настаивали представители командования Карельского фронта (Мерецков К.А., Штыков Т.Ф., Калашников К.Ф., Грушевой К.С., Мельников Д.И. и др.). Подлинник протокола № 169 заседания Секретариата ЦК партии, подписанный секретарем ЦК Г.М. Маленковым (он вел заседания и руководил работой Секретариата), включает материалы с хронологическими рамками от 28.08 по 12.09.1944 г. Конечно, в двухнедельном ежедневном режиме, тем более в условиях военного времени, Секретариат собираться не мог, многие вопросы решались заочно, по телефону, или же членам Секретариата высылались специальные бланки, в которых нужно было выразить свое согласие или высказать возражения. Данная процедура вошла в обычную практику во время войны.