Тогда же шла работа над «Очерками Джунгарии», которые принесли Чокану Валиханову известность в научном мире не только России, но и Германии, и других стран Западной Европы. В Петербурге Чокан встречался с известными востоковедами: Владимиром Владимировичем Веньяминовым-Зерновым, Галсаном Гомбоевым, Александром Касимовичем Каз-Беком. Он непосредственно участвовал в составлении «Карты пространства между озером Балхаш и хребтом Алатау», «Рекогносцировки западной части Заилийского края», «Плана города Кульджи», «Карты к отчету о результатах экспедиции на Иссык-Куль», «Карты Западного края Китайской империи». Описание пути в Кашгар и обратно в Алатавский округ, подготовленное Чоканом Валихановым тогда же в Петербурге, вышло в свет в 1868 году, уже после смерти автора. Он умер 10 апреля 1865 года, не дожив и до тридцати лет (родился в ноябре 1835 года).
Попытки европейских путешественников проникнуть в загадочную Кашгарию заканчивались неудачно. В 1857 году в Кашгаре погиб известный немецкий путешественник и исследователь Адольф Шлагинтвейт, верные сведения о его гибели доставил Чокан. Казахскому ученому первому выпала честь ознакомить мировую науку и общественность с политическим и торгово-экономическим положением Восточного Туркестана того времени. Об этом крае он написал 22 работы, главная из них – «О состоянии Алтышара, или шести городов китайской провинции Нан-Лу (Малой Бухарии) в 1858–1859 годах».
Рассказывая о дальнейшей судьбе Чокана Валиханова, уже штабс-ротмистра, И.И. Стрелкова пишет316
:«Работу над «Запиской»
317Чокан Валиханов закончил 28 февраля 1864 года. 8 марта в Омске появился полковник Черняев. Он направлялся в укрепление Верное, чтобы возглавить поход Зачуйского отряда на кокандскую крепость Аулие-Ата318. Следуя примеру Перовского и Муравьева-Амурского Черняев постарался заинтересовать ученых возможностью совершить путешествие в неведомые края. В походе согласились принять участие зоолог Н.А. Северцов, энтнограф Ю.Д. Южаков, художник М.С. Знаменский. Дюгамель (новый Западно-Сибирский генерал-губернатор) писал военному министру Д.А. Милютину, что полковнику даны инструкции предложить киргизам присоединиться к России, а если правитель Ташкента или Туркестана изъявит желание, полковник Черняев должен вступить в предварительные переговоры. Для такого рода отношений при нем будет состоять штабс-ротмистр Валиханов, весьма ловкий и развитый азиатец, хорошо знающий русский и татарский языки».Дюгамель тут конечно «пересолил», так как военный министр Милютин и без его характеристик уже был знаком с Чоканом по его блестящему отчету по Кашгарии…
В тех краях, где Коканд понаставил свои крепости – Куртку, Пишпек, Токмак, Туркестан, Аулие-Ату, Чимкент, – издревле кочевали казахи и их родные братья киргизы. Кокандскому господству там приходил конец. В 1860 году отряд полковника Циммермана в 1 750 человек пехоты и конницы при 15 орудиях взял кокандские крепости Токмак и Пишпек. В этом походе участвовали казахские султаны, в том числе и Тезек (который впоследствии близко породнился с Чоканом), награжденный за храбрость золотой медалью и орденом святого Станислава…
Тогда же, в 1860 году, двадцатитысячное кокандское войско двумя отрядами двинулось на укрепление Верное…