Обе стороны попробовали продемонстрировать решимость в отстаивании своих позиций, следствием чего явилась серия вооруженных конфликтов в Илийском крае летом 1863 года. Уже 31 мая 1863 года китайцы напали на небольшой русский отряд из 12 человек, прибывший на китайский пограничный пикет Борохудзир. Командир отряда поручик Е. Антонов был вероломно изранен китайскими стрелками, но, пробившись сквозь толпы китайцев к своему отряду, …на другой день умер. Кроме того, были ранены хорунжий Елгин и 6 нижних чинов, 3 человека оказались в китайском плену. На следующий день состоялся бой между китайскими войсками и отрядом капитана Голубева. Через несколько дней русский отряд в составе полутора взводов пехоты, 25 казаков, сотни киргизской (казахской) милиции и взвода конно-артиллерийской казачьей батареи атаковал китайский отряд до 700 человек, перешедший на российскую сторону. Китайцы, потеряв до 50 человек убитыми, отступили к Борохудзиру. 22 июня произошел бой отряда подполковника Лерхе с китайскими войсками, которые отступили, оставив пограничный пикет Борохудзир и потеряв до 400 человек убитыми и ранеными. Далее нападения и бои продолжались. Согласно рапортам русских военных начальников, на реке Каркара российскому отряду противостояло до 5 тысяч человек, на поле боя осталось 35 погибших китайцев и много оружия. Вооруженные столкновения продолжались до конца июля 1863 года и показали полную бесперспективность силового решения вопроса. По взаимному согласию российского и китайского правительств, эти столкновения были признаны случайными, стороны сели за стол переговоров.