В Казани был расквартирован Крымский гарнизон. Он решил спастись бегством. Но это им не удалось. Большая часть личного состава была уничтожена. Князья и мурзы (всего 46 военных начальников) были отвезены в Москву. В Москве, где совсем недавно они убивали, жгли и грабили, уведя сотни тысяч пленных, они нашли свою смерть.
Русское войско захватило Казань без боя. Было образовано временное правительство. Возглавляли его Худай-Кул-оглан и князь Нур Али Ширин. Ими была послана делегация на мирные переговоры с русскими в Свияжск. Там было заключено перемирие сроком на 20 дней (пока будут идти переговоры в Москве).
Подписанный в Москве в августе 1551 года Московско-Казанский перемирный договор обязывал татар освободить русских полоняников, которые находились в рабстве у знатных казанцев (князей, мурз, дворян), а так же тех, кто работал на рядовых татар. Новым казанским ханом назначался Шах-Али. Русскому правительству должны быть выданы малолетний хан Утямыш и его мать-регентша Сююн-Бике, а также семейства бежавших и казненных крымских татар. Правобережная (горная) часть Казанского ханства отходила к Москве. Последний вопрос было решено затвердить общим «собранием всей земли» – на курултае. Такой курултай состоялся 14 августа 1551 года в устье реки Казанки (в 7 км от Казани). В собрании (курултае) принимало участие всё мусульманское духовенство во главе с Кул-Шерифом ибн Мансуром. Это все шейхи, шейх-заде, муллы, муллы-заде, хаджи и дервиши. В курултае приняли участие все родственники ханов по всем линиям (огланы). Их возглавлял Худай-Кул-оглан. Присутствовали также все князья и мурзы. Их возглавлял сын Булат-Ширина Нур-Али. Татарская верхушка на своем собрании утвердила присоединение горной стороны к России. Мирный договор был подписан. 16 – 18 августа татары присягали на верность русскому правительству и договору. Русских полоняников было освобождено 60 тысяч человек. В городе Свияжске было введено русское правление. Все русские войска были выведены, блокада прекращена. В Казани осталось русское посольство во главе с И.И. Хабаровым. Впоследствии его заменил князь Дмитрий Федорович Палецкий.
Несмотря на полное одобрение, татары послали в Москву делегацию с просьбой к царю изменить условия договора. Главное требование – вернуть горную часть ханства. В Казани был организован заговор против хана Шах-Али. Но он был вовремя раскрыт, и лидеры заговора были ханом казнены. Русское правительство решило учредить в Казани вместо хана пост наместника. Переговоры велись с татарским посольством, которое было задержано в Москве. Посольство советовало отозвать из Казани русский гарнизон, отпустить из Москвы задержанных татарских послов, татарскую мусульманскую администрацию в Казани оставить без изменения, сохранить автономию Казанского ханства в экономическом и финансовом отношении.
6 марта 1552 года в Казани была объявлена царская грамота о ликвидации ханства. Наместником в Казани назначался свияжский воевода князь Семен Иванович Микулинский. 7 марта все казанцы были приведены к присяге наместнику и царю. Льготы и привилегии русского дворянства распространялись на татарское дворянство.
В Казань направились наместник князь Микулинский с русским гарнизоном и со свитой. На удалении двух километров от Казани от свиты наместника отделились три казанских аристократа – князья Кабек, Ислам и мурза Алик Нарыков. Они поскакали в Казань организовать встречу. И организовали – в Казани они призвали всех вооружаться и заперли ворота перед носом наместника, всей свиты и русского военного отряда.
Вот в этом в очередной раз проявилось вероломство казанских татар. После общего одобрительного собрания они от всего отказались и взялись за оружие. Их можно понять – по договору запрещалось рабство христиан-пленников, а они привыкли, чтобы на них работали русские рабы, семьи которых они изрубили шашками при захвате.