Свои взгляды министр Пфордтен в отношении политики Баварии, в частности ее позиции внутри Германии, сформулировал еще в 1851 году Пфистермайстеру: «Бавария должна как можно дольше оставаться в Германском союзе, но быть бесстрашно подготовлена к его роспуску; в этом случае Бавария не должна уступать ни Пруссии, ни Австрии, а укреплять свою независимость и сплотить Юго-Западную Германию».
При своем назначении Пфордтен представил королю Людвигу программу, по сути, концепцию «Триады» Максимилиана: «В Германии функция Баварии не преследует ни австрийскую, ни прусскую, а баварскую и германскую политику, а это означает – политику Великой Германии. Поэтому Бавария должна стремиться не к конфликту между Австрией и Пруссией, а к их примирению в рамках закона Союза».
Несмотря на твердые убеждения Пфордтена оставаться нейтральным, Бавария поддерживала Австрию и была настроена против прусского малогерманского пути объединения Германии, который исключал Австрию. Растущая напряженность между Пруссией и Австрией вызывала беспокойство у Людвига II.
Особенно усилились конфликты с февраля по лето 1865 года. Велись длительные переговоры между германскими государствами. Пфордтен не возражал, чтобы Пруссия заключила военный союз с герцогством, главное требование Баварии было – уважать законные права герцога Августенбургского и суверенитет германских территорий, и поэтому аннексия Шлезвиг-Гольштейна была неприемлемой.
В феврале Бисмарк выдвинул свои требования к герцогствам, по которым они фактически бы полностью подчинялись Пруссии. Такие требования были повсеместно отвергнуты, поскольку теперь все понимали, что герцог Шлезвиг-Гольштейнский, поставленный на прусских условиях, не считался бы равным членом Германского союза. Бавария вместе с Саксонией и при поддержке Австрии представили в бундестаге резолюцию, чтобы герцог Августенбургский был объявлен законным суверенным правителем Шлезвиг-Гольштейна. В бундестаге поддержали предложение девятью голосами против шести. Бисмарк видел, что Австрия не смирится с утратой своей гегемонии в Германии. Но без этого и без разрушения Германского союза Пруссия иначе не могла воплотить свои цели. А это означало рано или поздно столкновение в военном конфликте с Австрией. К тому же весной в Киле была размещена прусская военная база. Конфронтация возрастала и, таким образом, два крупных германских государства оказались в противоположных лагерях.
Коронный совет в Берлине 29 мая стал важным этапом на пути к войне, на котором обговаривались отношения Пруссии и Австрии и проблема герцогств. Кроме кронпринца Фридриха Прусского почти все участники высказались за аннексию герцогств. Бисмарк возразил кронпринцу, который поддержал герцога Августенбургского, о неизбежности войны с Австрией, для которой складывается благоприятный момент.
Лето 1865 года выдалось особенно горячим в переговорах. Австрийцы предложили Пруссии уступить герцогства, посулив в обмен территориальные компенсации, от которых Вильгельм I отказался. 21 июля Регенсбург получил от Пруссии ультиматум, что если Австрия не присоединится к Пруссии в подавлении выступлений герцога Августенбургского в герцогствах, то они будут действовать в одиночку. Министр Пфордтен после встречи с Бисмарком и Вильгельмом I в Зальцбурге уведомил Людвига о решенных действиях Пруссии, и что Баварии следует придерживаться компромисса в отношении Австрии и герцога Августенбургского и при вспышке войны как можно дольше придерживаться нейтралитета.
Баварское предложение запоздало. Австрия и Пруссия договорились о совместном управлении герцогствами. Это была всего лишь отсрочка, но не решение проблемы. 14 августа на Гаштейнской конференции было закреплено, что каждая из сторон получает в управление одно из герцогств; в Киле сохранялась прусская военно-морская база; Шлезвиг-Гольштейн включался в Таможенный союз.
Гаштейнская конвенция вызвала всплеск возмущения в Южной Германии из-за отрицания законных прав герцога Августенбургского, конституционных полномочий Германского союза, демонстрации Австрией и Пруссией своего высокомерия и полного пренебрежения в отношении законности и прав небольших государств. Бисмарку предоставлялась возможность в любой момент вызвать конфликт вокруг Шлезвиг-Гольштейна, а пока лишь создавалась видимость сближения Австрии и Пруссии. Но все это носило лишь временный характер. «Разногласия не устранены, и остается открытым вопрос о том, можно ли добиться этого мирным путем. …Решение главного вопроса лишь отсрочено», – писал Бисмарк фон дер Гольцу в Париж.