Подобная односторонность планирования впоследствии дорого обошлось не только РККА, но и самому Балтийскому флоту. В итоге, оперативный план КБФ накануне Великой Отечественной войны носил весьма односторонний характер, будучи ориентированным лишь на благоприятную для Советского Союза оперативно-стратегическую обстановку в начале войны. Предполагалось, что при любом развитии ситуации на сухопутном фронте ничто не будет угрожать стабильному положению приморских флангов РККА. Соответственно, и Военно-Морской Флот исходил из таких же оптимистических предпосылок. Это было характерной чертой всего предвоенного советского военного планирования.
На наш взгляд, в сложившейся ситуации оперативный план КБФ следовало больше ориентировать на выполнение оборонительных задач, делая особый упор на сухопутной обороне военно-морских баз. Но именно с организацией сухопутной обороны военно-морских баз накануне войны возникла большая проблема, объяснявшаяся позицией руководства Наркомата обороны СССР и Генерального штаба РККА. Поэтому вопрос о обороне баз в случае войны оказался нерешенным из-за нежелания армейского командования заниматься флотскими вопросами и излишне оптимистического взгляда на начальный этап войны.
Но командованию флотом, естественно, не хотелось ограничиваться лишь оборонительными задачами (тем более что руководство Наркомата ВМФ имело свои амбиции). В результате, в плане были широко представлены активные операции. Однако, приходится констатировать, что в условиях реальных боевых действий на Балтике летом и осенью 1941-го года КБФ оказался не силах завоевать и удержать господство в Финском заливе. Более того, Балтийский флот не смог надежно прикрыть свою основную коммуникацию Таллин-Кронштадт, чем и объяснялись успешные минные постановки немцев и финнов в устье Финского залива накануне и в начале войны, что привело к большим потерям во время печально известного «Таллинского перехода».
Подводя итоги рассмотрению оперативных планов КБФ, следует заметить, что командованию ВМФ довольно трудно было предугадать реальный ход событий начала войны. Тем более, нельзя было предвидеть всех масштабов той катастрофы, которая постигла Вооруженные Силы СССР в начале Великой Отечественной войны. Вряд ли кто-либо из высшего командования ВМФ в мирное время мог всерьез подумать о том, что линия фронта приблизится к Ленинграду, а Балтийский флот будет находиться на грани уничтожения. К сожалению, общая направленность планов армейского командования в 1940–1941 годах носила наступательный характер и способствовала формированию такой же стратегии и у Военно-Морского Флота. И всё же, высшим командованием ВМФ и КБФ накануне Великой Отечественной войны был допущен определенный просчет в составлении плана будущей войны, в силу чего не удалось предусмотреть даже примерный характер действий флота в реальной боевой обстановке. А это в свою очередь привело к неудачному для Балтийского флота развитию событий на Батике летом – осенью 1941-го года.
В период с сентября 1939 года по июнь 1940 года Краснознаменный Балтийский флот являлся важным фактором в деле укрепления обороноспособности северо-западных рубежей Советского Союза. Причем, высшее партийное и военное руководство широко использовало КБФ в качестве удобного инструмента для достижения своих политических целей, причем весьма успешно. Например, действия Балтийского флота в сентябре 1939-го и в июне 1940-го годов помогли быстро решить проблему политического подчинения, а затем и прямого присоединения республик Прибалтики к Советскому Союзу. В ходе этих внешнеполитических акций Краснознаменный Балтийский флот не применял оружия, но проводил операции по поиску подлодок, перевозке десанта и блокаде неприятельского побережья.