Там Чапаев получает назначение командиром Александрово-Гайской бригады, сформированной из призывников Заволжья. Ее комиссаром был Д.А. Фурманов. Перед бригадой ставится задача овладеть станицей Сломихинской, после чего наступать на Лбищенск, заходя в тыл Уральской белоказачьей армии.
Бригадой командовать В.И. Чапаеву долго не пришлось. Фрунзе приказал воссоздать заново ранее расформированную 25-ю стрелковую дивизию, которую Василий Иванович принял в апреле. Дивизия состояла из трех бригад: 75-й Александрово-Гайской Потапова, 73-й Кутякова и 74-й, составленной из трех стрелковых полков – иваново-вознесенских, сызранских и московских рабочих. Командиром дивизии назначается Чапаев, комиссаром – Д.А. Фурманов.
В середине апреля 1919 года командование Южной группой армий Восточного фронта для проведения наступательной операции на Бузулук создает ударную группу, получившую наименование Бузулукской. В ее состав включалась вся Туркестанская армия под командованием Г.В. Зиновьева, усиленная чапаевской 25-й стрелковой дивизией. Введение в состав ударной группы именно 25-й дивизии, а не другой иной, говорило, прежде всего, о ее боевой репутации.
Замысел операции состоял в том, что Бузулукская группа действовала на главном направлении. В ее состав входили от чапаевской дивизии 74-я и 75-я стрелковые бригады. 73-я бригада приказом М.В. Фрунзе передавалась на усиление 5-й армии М.Н. Тухачевского. Чапаев был против такого временного «раскассирования» дивизии, но с приказом приходилось считаться. В ходе наступления была форсирована река Малый Кинель, разбит заслон белых войск и 4 мая захвачена железнодорожная станция Бугуруслан. Белый фронт усилиями чапаевцев был прорван на 80 километров.
Красные войска взяли в свои руки контроль над железной дорогой Самара – Уфа на участке от Сарай-Гара до Бугуруслана. Теперь флангу и тылу колчаковской Западной армии угрожала серьезная опасность.
Выйдя в верховья реки Сок, войска 5-й армии столкнулись с предпринявшей 9 мая контрудар группой белых войск генерала С.И. Войцеховского. В трехдневном ожесточенном сражении противник был разбит; тяжелые потери понесла белая рабочая Ижевская бригада. Войска армии Тухачевского захватили свыше 2 тысяч пленных, 3 орудия и большое количество пулеметов.
Рещающий вклад в эту победу внесла 25-стрелковая дивизия (начдив В.И. Чапаев, военный комиссар Д.А. Фурманов), которая, изменив направление наступления на северо-восток, лишила группу генерал Войцеховского возможности нанести удар во фланг 5-й армии и приняла на себя основную тяжесть контрудара белых войск. И не только выстояла, но и отбросила атакующего противника от себя, заставив его отступить.
Командующий Южной группой армий Восточного фронта М.В. Фрунзе объявил бойцам, командирам и комиссарам чапаевской дивизии революционную благодарность. Фамилия Чапаева еще раз прозвучала в донесениях в адрес Реввоенсовета Республики, Главнокомандующего ее Вооруженными силами и Совнаркома.
Затем командование Восточного фронта во главе с А.А. Самойло занялось разработкой операции по разгрому группы войск генерала В.О. Каппеля, одного из лучших военачальников адмирала Колчака. Группа имела в своем составе около 17 тысяч штыков и сабель, 46 орудий, 172 пулемета. Удар по каппелевцам наносила Туркестанская армия, усиленная 25-й, 24-й и 2-й стрелковыми дивизиями: всего около 23 тысяч штыков и сабель, 119 орудий, 560 пулеметов.
Когда Фрунзе отдал приказ о наступлении, бои за Белебей уже шли. Передовые войска усиленной Туркестанской армии упредили удар белого Волжского корпуса, нанесли поражение его авангардам и заставили отступить. Генерал Каппель отходил в готовности начать новое сражение в предгорьях Урала.
Встал вопрос освобождения города Уфы. Фрунзе в первый эшелон наступающей Туркестанской армии поставил три стрелковые дивизии, в том числе чапаевскую. Наступление велось с 25 мая по 3 июня. Решающую роль сыграли сильные передовые отряды. Действуя впереди главных сил, они за девять дней продвинулись вперед на 120–130 километров. Особенно отличились в этих боях 25-я и 20-я стрелковые дивизии. В тех боях дивизия В.И. Чапаева ударами по флангам неприятельской укрепленной позиции у станции Чишма вынудила арьергардные части Волжской группы отступить на восток.
30 мая М.В. Фрунзе решил уточнить план Уфимской наступательной операции. Было решено взять город одновременными ударами силами двух дивизий (стрелковой и кавалерийской) с юга и 25-й стрелковой дивизии с запада. Командарм потребовал от начдивов форсировать реку Белая с ходу.
В чапаевской дивизии началась лихорадочная подготовка к преодолению водной преграды. Самым главной заботой стал поиск переправочных средств – лодок и изготовление плотов. Велась разведка мест назначенных переправ. Ширина реки Белой достигала здесь 150–180 метров, местами до 300 метров, глубина – 5–6 метров, а скорость течения составляла 0,5 метра в секунду. Правый берег реки господствовал над левым, что облегчало колчаковским войскам оборону.