Не особенно преуспев в бизнесе и не имея большого опыта в управлении, Буш выбрал в вице-президенты Дика Чейни, убежденного консерватора, сделавшего успешную карьеру в палате представителей и присоединившегося к команде республиканских лидеров, где его избрали организатором партийного меньшинства. Он мог бы занять место спикера, но согласился занять пост министра обороны в первой администрации Буша. При несомненной поддержке Буша-младшего Чейни вскоре стал значимой фигурой в вопросах национальной политики. Один из самых влиятельных вице-президентов в американской истории, он пользовался почти таким же авторитетом в иностранных и внутренних делах, как и сам президент, а вместе им удалось укрепить исполнительную власть и ее прерогативы. Буш также привел в Белый дом старшего советника Карла Роува, которого он называл «архитектором» своих побед, спланировавшего стратегию, позволившую Бушу стать губернатором Техаса и президентом Соединенных Штатов Америки.
Почти столь же важную роль играл организатор меньшинства в палате представителей Том Делей. Еще один непримиримый консервативный республиканец, он проводил жесткую политику и практически отстранил демократов от какого-либо участия в делах палаты. Делей стал вдохновителем так называемого «проекта K Street», по названию улицы в Вашингтоне, где расположены многие лоббистские фирмы. Вскоре поползли слухи о том, что лоббисты, желающие повлиять на законодательный процесс, должны делать финансовые взносы в Республиканскую партию. Поддержка демократов обеспечит поражение любого проекта, продвигаемого лоббистами. Многие бывшие члены конгресса, уйдя в отставку или не добившись переизбрания, оставались в Вашингтоне и, имея хорошие связи в конгрессе, присоединялись к лоббистским кампаниям. Таким образом, лоббисты вложили немалые деньги в кампании республиканцев, а Том Делей, умело используя это преимущество, добился строгой дисциплины среди конгрессменов-республиканцев. Законодательное собрание Техаса укрепило его влияние, перекроив избирательные округа и создав еще пять республиканских районов, что обеспечило партии большинство в палате представителей. После промежуточных выборов 2002 г. республиканцы контролировали сенат. Теперь уже две ветви федеральной власти, исполнительная и законодательная, оказались во власти одной партии, что позволило президенту навязывать стране свою политику. В первый президентский срок Бушу не пришлось наложить вето ни на один законодательный акт.
После довольно бурной молодости Буш вновь обратился к христианству благодаря жене Лоре и служителю баптистской церкви преподобному Билли Грэму, и свой президентский срок он начал с программы, названной Инициативами, основанными на вере, то есть с программы привлечения верующих и религиозных организаций к решению социальных проблем, таким образом обеспечив федеральную поддержку программ, связанных с церквами и направленных, в частности, на борьбу с подростковой беременностью. Тогда же он запретил федеральную поддержку исследований стволовых клеток, одного из самых современных методов для изучения новых путей борьбы с заболеваниями и развития здравоохранения. Очевидно, связанный с «религиозными правыми», что, по мнению Карла Роува, укрепляло консервативную базу президента и обеспечивало господство республиканцев в национальной политике на долгие годы, Буш хотел сделать свою администрацию морально безупречной и искоренить пороки в правительстве.
Масштабная реформа системы образования стала одной из важнейших инициатив, предпринятых вскоре после инаугурации. По программе «Ни один ребенок не забыт», направленной на улучшение начального и среднего образования, деньги из федерального бюджета выделялись тем образовательным учреждениям, которым удавалось повысить уровень знания математики, естественных наук и английского. Но, вводя федеральные стандарты по этим предметам (историков разочаровало то, что их предмет не вошел в список), программа подрывала авторитет школьных советов в штатах и на местах и, по мнению критиков, делала упор не на обучении, а на тестировании.
Вскоре стало очевидным, что администрация Буша поддерживает и стремится отстаивать интересы американского бизнеса. Окончательную ясность внесло секретное совещание вице-президента Чейни, бывшего исполнительного директора Halliburton, лидера в области нефтяного оборудования, проведенное с руководителями нефтедобывающих компаний. Участники договорились об энергетической политике, разрешавшей бурение нефти в Национальном Арктическом заповеднике на Аляске и предоставлявшей субсидии для добычи нефти в Мексиканском заливе. Администрация также истолковала Закон о чистом воздухе в пользу энергопредприятий и назначила в Агентство по охране окружающей среды руководителей, понимавших значение корпоративного партнерства.