директор: генерал армии Николай Павлович Аброськин (с 9.4.2004)
1-й заместитель директора: генерал-лейтенант Алексей Николаевич Немков (с 2009)
заместитель директора – главный инженер: генерал-майор Александр Васильевич Ходос
заместитель директора по строительству объектов специального назначения: генерал-майор Василий Петрович Богомолов (с 2009)
заместитель директора по капитальному строительству и промышленности: генерал-лейтенант Владимир Владимирович Мирзоев
заместитель директора по специальному строительству:
Центральное производственно-распорядительное управление
Штаб
Управление экономики, финансов и бухгалтерского учета
Управление кадров и образования
Управление проектирования, капитального строительства и имущественных отношений
Управление подготовки производства
Управление организации договорной работы и ценообразования
Управление делами и защиты государственной тайны
Управление информации и связей с общественностью
Правовое управление
Контрольно-ревизионное управление
Отдел охраны труда и технических инспекций
Отдел дорожного строительства
МИНИСТЕРСТВО ЮСТИЦИИ РФ