5 июня 1906 г. именным Высочайшим указом Правительствующему сенату из состава Главного морского штаба была «выделена стратегическая часть в отдельное в составе морского Министерства
учреждение» — Морской генеральный штаб (МГШ)[877]. Согласно со «Статьями к книге I Свода морских постановлений», по штатной организации 1906 г. МГШ включал 15 офицеров и состоял из оперативной части, военно-исторического отдела, двух отделений (русской и иностранной статистики) и делопроизводства по мобилизации. Разведывательные функции в МГШ возлагались на отделение иностранной статистики. Назначенный на должность заведующего этого отделения капитан 2 ранга Л. Б. Кербер[878], опираясь на опыт последней войны, представил 8 (21) августа 1906 г. доклад «О необходимости организации морской разведки» и выделил два вида разведки, которые должен организовывать МГШ: явную и тайную. К представителям явной разведки он отнес военно-морских агентов, консулов, членов Морской лиги, сотрудников крупных пароходных компаний, капитанов частных судов (офицеров запаса флота). Но, как отмечал Кербер, «им разрешают видеть то, что им показывают, они не вездесущи, поэтому невозможно составить объективное мнение о настоящих замыслах [противника]»[879]. Этот недостаток могла бы устранить тайная разведка. К силам тайной разведки Кербер отнес «главных агентов, которые замыкаются непосредственно на центральные учреждения разведки (на Генеральный штаб, МГШ, штабы флотов и др.) и второстепенных агентов, которые могут находиться в подчинении: а) главных агентов; б) центральных учреждений разведки (МГШ, штабов флотов и др.); в) военно-морских агентов».Первоначально предполагалось, что в мирное время организация будет немногочисленна: на каждом из двух театров (Балтийском и Тихоокеанском) будет 2–3 главных агента и по 9 второстепенных агентов, причем Черноморский театр в 1906 г. в расчете сил и средств разведки не участвовал.
Позднее, согласно «Временному положению
об управлении Морским ведомством» от 18 июня 1908 г., МГШ получил новую организационную структуру и включил в себя организационно-мобилизационную, оперативную, иностранную, военно-историческую части и канцелярию[880]. Иностранная часть выступила преемницей отделения иностранной статистики в вопросах организации и ведения разведывательной деятельности. В 1908–1909 гг. начальником иностранной части являлся капитан 2 ранга Б. И. Доливо-Добровольский. В январе 1910 его на этом посту заменил старший лейтенант М. И. Дунин-Борковский[881].