Практическая деятельность флота Открытого моря началась в феврале 1913 г. в проливе Каттегат и Северном море с учений разведывательной группы. В марте к этим учениям подключились I-я линейная эскадра дредноутов с IV-й, V-й и VI-й флотилиями миноносцев. 4 марта у о. Гельголанд произошла очередная катастрофа. Броненосный крейсер “Йорк” таранил и потопил миноносец S-178, унёсший с собой на дно 69 человек.
С 10 марта к учениям присоединилась П-я линейная эскадра дО-дредноутов, 5-я дивизия (“Кайзер”, додредноуты “Брауншвейг” и “Эльзас”), I-я и И-я флотилии миноносцев, а на заключительном этапе остальные соединения флота Открытого моря. С 12 марта вице-адмирал фон Ингеноль впервые взял на себя непосредственное руководство флотскими учениями, успешно закончившимися 14 марта. Отныне “Кайзер” принимал участие в череде обычных учений в качестве флагманского корабля 5-й дивизии, в том числе в марте-апреле в учениях в Северном море.
В марте 1913 г. флот Открытого моря имел следующий состав: флагманский корабль “Фридрих дер Гроссе” I-я эскадра (восемь дредноутов): командующий эскадрой и одновременно 1-й дивизией вице-адмирал Ланс; младший флагман и командующий 2-й дивизией контр-адмирал Шауман. 1-я дивизия: “Остфрисланд” (флагманский корабль командующего эскадрой), “Тюринген”, “Гельголанд”, “Ольденбург”; 2-ядивизия: “Позен” (флагманский корабль младшего флагмана), “Рейнланд”, “Нассау”, “Вестфалец” и посыльное судно “Блитц”.
II-я эскадра (семь додредноутов): 3-я дивизия: “Прёйссен” (флагманский корабль командующего эскадрой), “Поммерн”, “Гессен”, “Лотринген”; 4-я дивизия: “Ганновер” (флагманский корабль младшего флагмана), “Шлезиен”, “Шлезвиг-Гольштейн”, “Дёйчланд” и посыльное судно “Пфайль”.
II-й эскадрой и одновременно 3-й дивизией командовал контр-адмирал Шеер, младшим флагманом и одновременно командующим 4-й дивизии назначили контр-адмирала Сушона. В феврале во время ремонта на верфи додредноута “Ганновер” младший флагман перенёс свой флаг на борт “Дёйчланда”. В конце сентября контр-адмирал Сушон вступил в командование Средиземноморской дивизией, и в должность младшего флагмана вступил капитан 1-го ранга Мауве.
5-я дивизия III-й эскадры: командующий 5-й дивизией контр-адмирал Шмидт; дредноут “Кайзер” (флагманский корабль командующего дивизией), додредноуты “Эльзас” (с 14 мая дредноут “Кайзерин”) и “Брауншвейг” (с 31 июля “Кёниг Альберт”).
В апреле 1913 г. во время учений 1-й эскадры командующий флота Открытого моря перенёс свой флаг на борт посыльного судна “Хела”, поскольку накануне “Фридрих дер Гроссе” ушёл на верфь на гарантийный ремонт.
В конце апреля в Балтийском море состоялись учебные артиллерийские стрельбы, в которых принимал участие “Кайзер”. Между тем в мае в состав 5-й дивизии планировали ввести “Кайзерин”, к этому времени находящийся в стадии проведения сдаточных ходовых испытаний, и готовили к выводу в вооружённый • резерв “Эльзас”.
С 5 по 27 мая в Северном море прошли манёвры флота Открытого моря, где вперые отрабатывались совместные действия флота с береговой артиллерией острова Гельголанд. В мае в учениях флота в составе 5-й дивизии принимали участие “Кайзер”, “Кайзерип” (с 14 мая в составе флота, одновременно проводя сдаточные ходовые испытания) и додредноут “Брауншвейг” (до конца июля).
В манёврах также приняли участие лёгкий крейсер “Гамбург” с несколькими подводными лодками. Подводная лодка U-9 под командой капитан-лейтенанта Веддингена в результате четырёх атак по решению посредников условно потопила и повредила три линкора. По окончании манёвров “Фридрих дер Г россе” с кораблями 5-й дивизии, П-й линейной эскадры и лёгкими крейсерами ушёл в Киль.
Во время Кильской недели по приглашению кайзера Вильгельма II король Италии Виктор Эмануэль III и королева Хелена прибыли в Киль, где вместе с кайзером осмотрели находящиеся там новейшие германские корабли — дредноут “Кайзер” и линейный крейсер “Зейдлиц”.
Во второй половине июля — начале августа 1913 г. флот Открытого моря провёл летний поход у берегов Норвегии. В походе приняли участие “Фридрих дер Гроссе” и “Кайзер”, которые в ходе похода вместе с посыльным судном “Хела” посетили Балхольмен (Норвегия), где присутствовали на открытии памятника Фритьофу. В июле в время похода кораблей флота к берегам Норвегии по заданию кайзера Вильгельма II устаревший линкор “Виттельсбах” в качестве подарка норвежскому народу должен был доставить в Балхольмен статую Фритьофа, созданную немецким профессором Унгером.