Уступки, сделанные правительством Церкви в 1956 и 1957 годах, были очень узкими по своему характеру, и предпринимались попытки максимально использовать их в интересах режима. Разрешая и даже поощряя переписку с Ватиканом по поводу хиротонии новых епископов, советское правительство в первую очередь не заботилось о нуждах литовских католиков. Гораздо важнее были цели пропаганды и ее влияние на управление Церковью: ожидалось, что если каноник Станкявичюс или каноник Мажелис получит титул епископа, управление Литовской церковной провинцией может стать более централизованным. Заботясь о хиротонии новых епископов, советский режим всячески пытался воспрепятствовать возвращению в Литву епископов Т. Матулиониса, П. Раманаускаса и архиепископа Мечисловаса Рейниса, отбывших наказание. В конце 1953 года МВД ЛССР добилось того, что епископ Матулионис был переведен из Владимирской тюрьмы в хоспис Зубова Поляна в Мордовии. Таким же образом, узнав в конце 1954 года, что епископ Раманаускас может быть досрочно освобожден из тюрьмы из-за плохого состояния здоровья, руководство республики попросило, чтобы ему не разрешали возвращаться в Литву, а отправили в дом для инвалидов. Эта просьба была удовлетворена, и епископу пришлось провести еще два года в трудовом лагере для инвалидов в Абезе, Республика Коми, Россия. 8 ноября 1953 года архиепископ Рейнис скончался при не до конца выясненных обстоятельствах во Владимирской тюрьме.
В 1950-х годах впервые в Советской Литве были официально напечатаны молитвенники и католические календари. Четыре тиража молитвенников (общий тираж составил 75 000 экземпляров) должны были хотя бы частично удовлетворить высокий спрос на них. С другой стороны, советский режим игнорировал еще большую потребность католиков в другой катехизической и духовной религиозной литературе. Хотя в 1956 году бюро ЦК КПК разрешило издавать журнал для священников тиражом 2000 экземпляров, было четко понятно, что журнал будет использоваться в основном в пропагандистских целях и будет подвергаться строгой цензуре. Видя это, епископ Палтарокас отказался делегировать представителей от епархии Паневежиса и Вильнюсской архиепархии в состав редакции журнала, и поэтому журнал не издавался.
Нестабильный баланс сил на верхушке советского режима и противоречивые инструкции по деятельности практически парализовали волю государственных чиновников, ответственных за антирелигиозную политику, поэтому контроль над религиозной жизнью значительно ослаб. Администраторы епархий стали чаще посещать приходы; священники смелее проводили катехизацию детей; увеличилось число прихожан. В 1953-1958 годах в Литве не было закрыто ни одной церкви, и верующие имели уникальную возможность в условиях советского режима строить новые или восстанавливать церкви, разрушенные во время войны. 30 марта 1957 года Совет Министров ЛССР принял решение разрешить восстановление небольшой церкви в Круопяе, а 27 апреля 1957 года разрешил завершить начатое до войны строительство кирпичной церкви в Швенченеляе. В 1956 году советские власти также решили не разрушать, а перенести в другие места деревянные церкви Румшишкеса и Кампишкяй, когда после строительства Каунасской гидроэлектростанции вода в реке Нямунас выйдет из берегов.
Самые большие надежды литовских католиков были связаны со строительством новой церкви в Клайпеде. Большая церковь в стиле современной архитектуры была построена в рекордно короткие сроки: 30 июня 1957 года епископ Мажелис освятил краеугольный камень, и уже в августе 1960 года ожидалось официальное освящение новой церкви. Новые церкви могли бы строиться еще интенсивнее, если бы руководители ЛССР и в первую очередь Снечкус не стал бы возражать против планов CARC, согласно которым в Литве и Латвии предусматривалось построить 10 новых и восстановить 15 католических церквей, разрушенных во время войны. С другой стороны, с 1956 по 1961 год для ремонта практически не требовалось государственных разрешений, строительные материалы можно было легко получить из государственных фондов по заявкам, поэтому в Литве началось своеобразное движение за восстановление церквей.
Священнослужители, закаленные в советских трудовых лагерях, придали дополнительный импульс жизнедеятельности Церкви. В 1953-1957 годах 238 священников вернулись из мест заключения в Литву. Некоторые из них вернулись сломленными физически и морально, но было много священников, которые не собирались подчиняться ограничениям, налагаемым режимом. Недаром представитель CARC пытался добиться, чтобы их не распределяли в более крупные приходы, в то время как КГБ усердно наблюдал за их деятельностью. Особую озабоченность местных властей вызвал епископ Т. Матулионис, вернувшийся в Литву в мае 1956 года, а осенью 1955 года рукоположенный в епископа Юлионас Степонавичюс.