Сообщник императора пришел на гору, целый день прятался там в лесу, а примерно в середине ночи подошел к воротам монастыря и принялся плакать и кричать: «Христиане, кто здесь живет! Кто бы вы ни были, откройте мне, чтобы я не достался в добычу хищным зверям или не упал в пропасть!» Ему открыли дверь, он вошел. По его одежде и бритому лицу Стефан сразу понял, что юноша был императорским придворным. «Вы действительно из императорского дворца?» – спросил он. «К сожалению, да, отец мой. Из-за злобы этого нечестивого императора мы вынуждены следовать ошибкам евреев, а это большая опасность для наших душ. Вот почему я с большим трудом бежал из этого ненавистного места, и рука Бога указывала мне путь! Почтенный отец! Не прогоняйте меня из вашего спасительного сообщества и дайте мне возможность получить от вас ангельскую одежду!» Благочестивый аскет вначале ответил: «Этого я не могу: будет слишком опасно, если тиран узнает об этом». Но Георгий настойчиво повторял свою просьбу, и в конце концов аскет уступил. Через три дня Георгий принял постриг и получил монашескую одежду. Еще через три дня он вернулся в императорский дворец. Император, чье желание исполнилось, поспешил как можно скорее отправить на гору Святого Авксентия большое войско. Солдаты разогнали учеников Стефана, сожгли монастырь и церковь, а святого отшельника хлестали бичом, скатывали в пропасти, били колючими ветками, оскорбляли, плевали ему в лицо. Вначале его держали в заключении в монастыре Филиппика возле Хрисополя; туда к нему приходили многие епископы-иконоборцы и пытались одержать победу над его стойкостью. Потом он был сослан на остров Проконнес, где вскоре собрались под его руководством почти все (кроме двух) монахи с горы Святого Авксентия. По словам его биографа, описание чудес, которые Стефан совершил тогда, заполнило бы целый том, а исцеления, которые он совершил, призывая на помощь иконы, были такими поразительными, что слух о них дошел до ушей императора.
Обвиненный государем в том, что учит народ почитанию икон, святой Стефан был привезен в Константинополь, где на него надели цепи и путы и бросили его в тюрьму. Он несколько раз беседовал с Константином; оба говорили грубо и резко, и эти беседы не улучшили их отношения. Стефана отвели в Преторий, и там он встретил не меньше 392 монахов из разных местностей, оказавшихся в заключении за нежелание подписаться под законом, направленным против святых икон. Некоторым из этих заключенных выкололи глаза, другим отрезали нос, кисти рук или уши, нескольким вырвали волосы, еще нескольким сожгли бороду, намазав ее смолой. Все эти мужественные борцы приняли Стефана как посланца Неба, как наставника, которому поручено научить их спасению души. Под его руководством Преторий стал монастырем, и все там делалось согласно монашескому уставу. Они побуждали друг друга к терпению, рассказывали друг другу как примеры истории монахов, отличившихся своей доблестью во время преследований, больше прежнего каялись и умерщвляли свою плоть в ожидании близкой борьбы, и все же, по словам биографа, Стефан среди этих мучеников веры был печален и недоволен собой оттого, что он единственный не перенес никакой телесной пытки и не лишился ни одной части тела ради общего дела. Похоже, что император и в самом деле отсрочивал применение кровавых мер до последней возможности. Он воображал, что преодолеет сопротивление святого, что легко одержит победу над Стефаном, раз взял его в плен. Поэтому, когда Стефану был вынесен смертный приговор, Константин захотел сломить его неукротимую энергию. «Идите в Преторий, – сказал он двоим из своих людей, – и от моего имени объявите Стефану с горы Авксентия: „Ты видишь, как я забочусь о тебе: я вырвал тебя у смерти, я дал тебе жить до этого дня, чтобы ты в свои последние минуты согласился сделать то, что так дорого для меня. Если вам удастся убедить его вашим красноречием, будет хорошо. Если нет, бейте его по спине и лицу столько раз, чтобы он умер от ударов“». Два императорских посланца вместо того, чтобы переубедить святого монаха, сами были им обращены в православие и вернулись, не выполнив поручение. Но на следующий день, 28 октября 767 года, отряд телохранителей ворвался в тюрьму; они вывели святого на улицу, и там он был убит камнями и палками. Примерно через сорок лет после его смерти дьякон Стефан описал его жизнь, взяв за основу свидетельства, которые получил из первых уст от родственников, друзей, союзников, соратников и учеников святого, а также от тех сторонников Константина Копронима, которые были еще живы в то время.