Но в 1756 году заключили союз Англия и Пруссия (на севере Германии). У англичан был самый сильный флот, они ринулись прибирать к рукам владения Франции в Америке и Индии. А прусский король Фридрих создал самую сильную в Европе армию. Полез захватывать соседние страны и области. Против них объединились Австрия и Франция, но Фридрих лупил и ту, и другую. Разбой Пруссии был опасен и для России. Елизавета тоже вступила в войну, её назвали Семилетней. Сражения шли на суше, наша армия побеждала. А Балтийский флот под командованием старенького адмирала Мишукова каждое лето выходил в море. Блокировал порты Пруссии, не пропускал туда суда. Ждал, не появятся ли союзники Фридриха, англичане. Но они так и не появились, для них было гораздо важнее отнять у французов Канаду и индийские колонии.
Однако на войне проявилась и плохая подготовка нашего флота. Русские войска на берегу моря осадили сильную крепость Кольберг (сейчас это Колобжег в Польше). Снабжение для них отправили морем, 27 транспортов (грузовых военных судов). Но они попали в сильный шторм, 11 транспортов утонули вместе с командами. Другие 16 раскидало по разным портам, они возвращались в плачевном виде. Войска под Кольбергом остались без продуктов, тёплой одежды, боеприпасов и отступили.
Тогда взять Кольберг поручили морякам. 15 августа 1760 года Мишуков привёл туда 27 линейных кораблей и фрегатов, 17 мелких и транспортных судов. По крепости открыли огонь, высадили десант контр-адмирала Мордвинова, 3 тысячи человек. Взяли укрепления на подступах к Кольбергу. Построили батареи, начали бомбардировку города. Но прошёл слух, что приближается огромная прусская армия. На самом деле врагов было всего 5 тысяч. Никто не стал этого проверять, поднялась паника. Солдаты и матросы бросили пушки, лезли в шлюпки, удирать. Мишуков и Мордвинов растерялись, не унимали их и не останавливали. А немцы из крепости выскочили и погнались, нахватали 600 пленных, 22 орудия, массу вещей и снаряжения.
Только с третьей попытки на Кольберг послали одного из лучших генералов, Румянцева. И Мишукова сняли с должности, командовать флотом назначили энергичного вице-адмирала Полянского. Его эскадра захватила в море 8 неприятельских судов, разгромила прусские береговые батареи, высадила десанты, закидала крепость ядрами и бомбами. Кольберг наконец-то взяли.
В 1762 году на престол взошла Екатерина II. Её не зря потом назвали Великой, как и Петра I. Она была женщиной умной, очень трудолюбивой. В отличие от Елизаветы, сама вникала во все дела и разбиралась в них. Обнаружила множество безобразий, злоупотреблений. Екатерина обратила внимание и на флот. Приказала устроить учения в Финском заливе возле Красной горки. Сама приехала посмотреть на царской яхте. Корабли разыгрывали между собой учебный бой, палили из пушек по городку, специально построенному на берегу. Но действовали так плохо, что два фрегата зацепились друг за друга снастями, долго не могли распутаться. По городку из орудий не попадали. Екатерина сказала, что корабли были похожи не на военные, а на голландских рыбаков, когда они выходят ловить селёдку. Поставила оценку: «У нас в излишестве кораблей и людей, но нет ни флота, ни моряков».
Царица повелела подтянуть обучение моряков. У неё был и особый дар – замечать талантливых людей. В армии она отметила Румянцева, Суворова, Кутузова. И на флоте сумела увидеть способности Спиридова, Чичагова, Сенявина. Взяла их под покровительство, выдвигала на командные должности. Екатерина стала зазывать и лучших иностранных моряков, хорошо платила им. На наш флот перешли служить очень умелые англичане Грейг, Тревенин, Эльфинстон, голландец Кингсберген. А три десятка русских морских офицеров царица отправила для подготовки в Англию. Они на британских торговых судах совершали плавания в Америку, Индию, Китай, изучали разные моря и океаны.
Возобновились и исследования новых земель. Открытиями Беринга и Чирикова в Тихом океане заинтересовались сибирские купцы. Это же было очень выгодно – торговать с жителями открытых островов, промышлять там морских котиков, моржей, тюленей. Купец Никифоров построил небольшое судно. Командовали им моряк Глотов и казак Пономарёв. Они достигли Алеутских островов, открыли несколько новых. Даже привели местное население в подданство России.
Купец Толстых на своём судне «Святые Адриан и Наталья» открыл ещё 6 островов, назвал их Адриановскими. Их жители тоже приняли подданство России. Ряд открытий сделал купец Шилов. Губернатор Сибири докладывал об этом царице. Екатерина послала на Дальний Восток экспедицию капитана 2 ранга Креницына и капитан-лейтенанта Левашова. Они построили в Охотске бот «Святой Гавриил» и галиот «Святая Екатерина». Совершили несколько плаваний. Нанесли на карты Командорские, Алеутские острова, северный берег Аляски. Во время зимовки на Алеутских островах больше половины отряда умерло от цинги. А Креницын погиб от несчастного случая, утонул в реке. Левашов привёз материалы экспедиции в Петербург.