В 1928 году в газете «Рабочая Москва» была опубликована фотография Сретенского монастыря, огражденного забором, с пояснительной подписью: «Для расширения уличного движения сносится Сретенский монастырь, мешающий движению». Приход Сретенского монастыря был ликвидирован в 1928 году. В 1928–1930 годах снесены церковь Марии Египетской, церковь Николая Чудотворца, колокольня, монастырская стена. Соборный Владимирский храм был приспособлен под общежитие сотрудников НКВД, затем использовался как гараж и под помещения для реставрационных мастерских. В 1930-е годы снесены настоятельские покои и на их месте построена четырехэтажная школа. В 1950-е годы собор был поставлен на госохрану как историко-архитектурный памятник. Из старых построек Сретенского монастыря к 1990-м годам сохранились только три: Владимирский собор, совершенно опустошенный внутри и со сбитой росписью, двухэтажный хозяйственный корпус XVIII века, перестроенный в XIX веке, так что от первоначального здания остались лишь так называемые «ушастые» наличники на трех окнах (Большая Лубянка, 17), и часть настоятельского корпуса XVII–XIX веков в глубине двора.
В 1991 году храм Сретения Владимирской иконы Божией Матери был возвращен Церкви. С этого времени история Сретенского монастыря — это хроника возрождения обители, продолжающаяся и в настоящее время. В январе 1991 года во вновь освященном соборе началась служба. В 1994 году в монастыре разместилось подворье Свято-Успенского Псково-Печерского монастыря. В 1995 году возобновлена монашеская жизнь.
8 сентября 1995 года в ознаменование 600-летия встречи Владимирской иконы Божией Матери — события, в память которого основан монастырь, впервые после революции совершен традиционный крестный ход с чудотворной иконой из Успенского собора в Сретенский монастырь. Для крестного хода Третьяковской галереей был предоставлен подлинный образ Владимирской Божией Матери. Литургию в этот праздничный день совершал Патриарх Московский и всея Руси Алексий II.
В тот же день, 8 сентября 1995 года, патриархом освящен установленный в монастырском дворе, справа от ворот, у глухой стены соседнего дома, каменный резной памятный крест-распятие. Рядом с ним установлена медная пластина с надписью: «Крест воздвигнут в память православных христиан, умученных и убиенных на месте сем в годы смуты». Мне объяснили, что под «местом сим» имеется в виду весь окрестный район вокруг Большой Лубянки…
В 1997 году во Владимирском храме помещен выполненный в натуральную величину цветной фотографический снимок известной христианской святыни — так называемой Туринской плащаницы — полотна, которым было обернуто тело Иисуса Христа при погребении и на котором имеется отпечаток Его лица. С самого первого ее появления в одной из французских церквей в 1375 году подлинность плащаницы и изображения на ней вызывала сомнения и дискуссии, однако в настоящее время после проведения разнообразных исследований при помощи современных научных методов доказано, что плащаница относится к I веку, и точнее — к 30-м его годам.
Лик Христа на плащанице поражает своей выразительностью, здесь он предстает в двойной своей евангельской ипостаси: Сын Божий — Сын Человеческий.
В 1997 году на монастырской территории сооружена звонница.
В настоящее время Сретенский монастырь получил статус ставропигиального, то есть монастыря, пользующегося особыми привилегиями и подчиненного непосредственно патриарху. При монастыре имеется издательство, книжная лавка и магазин церковной утвари.
11 февраля 1998 году Комиссией Священного синода по канонизации святых было принято решение о причислении к лику святых священномученика Иллариона — архиепископа, игумена Сретенского монастыря.
10 мая 1999 года в соборе Сретения Владимирской иконы Божией Матери установлена рака с останками Иллариона, доставленными из Петербурга, и Патриарх Московский и всея Руси Алексий II за Божественной литургией совершил чин его прославления в лике святых. В решении Синодальной Комиссии по канонизации святых сказано: «Ревностный сторонник восстановления Патриаршества, ближайший помощник святителя Тихона, Патриарха Всероссийского, мужественный борец с расколами и последовательный поборник церковного единства священномученик Илларион претерпел изгнание и тюремное заточение, увенчав подвиг исповедничества за Христа кончиной в узах».
В проповеди, произнесенной после литургии, патриарх Алексий отметил также факты деятельности Иллариона, связанные со Сретенским монастырем: