История храма Живоначальной Троицы началась в 1833 г., когда в доме Мухановых по разрешению митрополита Филарета устроили домовую церковь. Службы в ней проводились приходским священником. После смерти С.И. Муханова его вдова Вера Дмитриевна получила на свое обращение к митрополиту указ Святейшего Синода от 30 ноября 1842 г. о сохранении домовой церкви из уважения к слабому здоровью статс-дамы В.Д. Мухановой и ее дочерей, не позволяющего им присутствовать при богослужении в приходской церкви. Мать и три сестры покинули земной мир раньше Марии Сергеевны. Одиночество, болезнь и страдания стали спутницами пожилой женщины. 12 декабря 1882 г. в возрасте 79 лет ее душа покинула бренное тело. Погребение состоялось в Троице-Сергиевой лавре. Душеприказчиками М.С. Мухановой являлись князь А.А. Щербатов и генерал-лейтенант А.С. Унковский – лица, хорошо известные в России своими благими деяниями. Они испросили у митрополита Московского Иоанникия разрешение оставить домовую церковь Мухановых в богадельне для совершения в ней богослужений для призреваемых. В 1893 г. богадельня перешла во владение церковно-приходского попечительства при Успенской церкви на Могильцах. Устав, на основании которого существовала богадельня, был утвержден Святейшим Синодом. Один из его пунктов предоставлял право членам Совета богадельни приглашать особого священника.
В исторических сведениях о церкви Успения Пресвятой Богородицы на Могильцах сохранились описания Троицкой церкви богадельни: «Домовая сия церковь устроена в виде палаты, длиною 5 сажен, шириною 3 сажени. Утварью снабжена достаточно. Замечателен иконостас в сей церкви; он пожертвован обершталмейстеру Сергею Ильичу Муханову покойным императором Александром Павловичем, и находился в походной его церкви. Местные иконы в этом иконостасе итальянской живописи и написаны на полотне».
По некоторым свидетельствам иконы Троицкого храма, в том числе и кисти Боровиковского, после закрытия богадельни передали в Исторический музей. Из-за ветхости здание мухановской богадельни разобрали. В 1960-е гг. на этом месте было возведено типовое строение детского сада.
Троицы в Больших Лужниках церковь
(уничтожена).Современная улица Бахрушина до революции именовалась Лужнецкой, по находившейся здесь в XVII веке конюшенной дворцовой слободе Большие Лужники. Храм здесь известен с 1625 г. Каменный Троицкий храм выстроили в 1638 г. В 1690 г. пристроили придел Усекновение главы Иоанна Предтечи, а в 1730 г. второй придел – святителя Николая.
В конце XVIII века возвели новую трапезную. Церковь закрыли в 1932 г., а разрушили – в 1933 г. Ныне на месте Троицкой церкви дом № 26 по улице Бахрушина.
Троицы в Борисове церковь
(Борисовский проезд, дом № 15, корпус 4).В древности здесь существовал приселок Борисовский села Коломенского. С XVI века уже числится дворцовое село Борисово, которым владела царица Ирина, супруга царя Федора Ивановича. От нее село перешло к ее брату – царю Борису Годунову. При нем здесь выкопали пруды и поставили плотину из белого камня. Борисовский пруд (ранее Цареборисовский) – самый большой в Москве, площадью в 86 гектара и средней глубиною в 2,5 метра. С 1960 г. Борисово находится в черте Москвы и является частью района массового жилищного строительства Орехово-Борисово. На месте села, на высоком плато стремительно выросло новое Борисово с большой улицей – Борисовский проезд. В селе стояла древняя церковь Святой Троицы, построенная в 1710 г. и разобранная за ветхостью в 1888 г. В 1880-е гг. выстроили новый каменный храм с главным престолом в честь праздника Живоначальной Троицы и с приделами иконы Божией Матери «Утоли моя печали» и святителя Николая. Его выстроили в русском стиле, хотя и в очень простых формах. Он небольшой, кубический, с пятью глухими куполами и одной полукруглой апсидой. На западном фасаде возвышалась трехъярусная шатровая колокольня.
В 1920-е гг. храм закрыли. В 1960 г. М.Л. Богоявленский записывает: «В настоящее время церковь стоит без крыши и колокольни, рам нет, на окнах сохранились железные решетки. Окна заложены досками и железными листами. На стенах растет трава. На двери замок. Помещение ее используется колхозом для складыванья зерна». К 1978 г. склад ликвидировали, здание пустовало. Храм, находившийся близ древней плотины, вместе с нею поставили на государственную охрану. Пруды в начале 1980-х годов подвергались реконструкции и очистке. Помещение же храма отдали автомотоклубу. В 1990 г. образовалась община верующих, и ей передали церковное здание. Начались ремонтные работы, и 14 сентября 1991 г. Троицкий храм вновь освятили.
Троицы на Борисовских прудах церковь
(улица Борисовские пруды, дом № 15, корпус 4).