Варваринский крестец Китай-города. Калики-странники и художник Алампий, подновляющий Варваринскую Богоматерь. Входит Анница с мертвым младенцем – никому его не отдает. Алампий хочет писать с нее глаза Богоматери. Юрод Василий Блаженный подменяет мертвого младенца двумя живыми подкидышами. Анница успокаивает Алампия, одержимого бесами.
Сцена 86
Москва. Успенский собор. Торжественный молебен о помощи Пскову. Царь посылает в Псков воеводу Ивана Шуйского.
Сцена 92
Александровская слобода. Теремная палата. Царь и бояре обсуждают осаду Баторием Пскова. Царевич в очередной раз просит дать ему войско – Иван отказывает и выражает недовольство Шереметьевыми – родом царевны, жены сына.
Сцена 93
Александровская слобода, покои царевича. Иван-сын жалуется Годунову на отца. Входит беременная Шереметьева, жена царевича. Годунов и царевич уходят. Вошедший царь, придравшись к наряду Шереметьевой, бьет ее по животу. Вбежавший царевич вступается, и царь бьет его железным посохом по голове. Царевич падает, тяжело раненный.
Сцена 94
Александровская слобода, покои царя. Царь кается в убийстве внука – Шереметьева родила мертвого ребенка. Приходит известие – царевич умер.
Сцена 95
На крестцах Китай-города. Народ, дворяне и купцы обсуждают смерть царевича – слухи самые разные. Иностранные послы предполагают, что и царь проживет теперь недолго.
Сцена 96
Троицкий монастырь. Царь кается и решает посмертно простить всех изменников – кроме Курбского – и послать большие суммы в монастыри. Нагой и Бельский обращают внимание царя на отсутствие Годунова – тот якобы притворился больным.
Сцена 97
Москва, покои в доме Годунова. Царь навещает больного Годунова, застает у него царевича Федора с его женой Ириной. Очень милостив ко всем троим. Велит наказать Нагого за наветы на Годунова. Говорит, что задумал провокацию – он объявит, что уходит в монастырь.