7 сентября 1654 г. Пронскому от имени царицы Марии Ильиничны царевича Алексея послан ответ: «Боярам нашим, князю Михаилу Петровичу Пронскому со товарищи. Писали вы к нам, что на Москве моровое поветрие множится гораздо и православных христиан остается малая часть, а вы себе то ж ожидаете смертного посечения… Да вам же извещал Московских тюрем дворянин Василей Сомороков, что тюремные целовальники и сторожи померли и вы о даче тюрмам сторожей и целовальников черных сотен и слобод соцким и старостам говорили, и соц-ким де и старосты вам сказали, что им в сторожи и целовальники ныне дать некого. И как к вам вся наша грамота придет, и вы б соцким и старостам говорили, чтобы они к тюрмам целовальников и сторожей дали… а вы б от морового поветрия жили в Верху (во дварце) с великим береженьем, а в наших и во всяких делех всем людем отказали, и наших и никаких дел не делали, и к нам ни о каких наших делах не писали, а которые впредь будут великие дела, и вы бы о тех делах писали Великому Государю под Смоленск».
Пронский это письмо, датированное 7 сентября, не получил, предчувствие его не обмануло — он умер 3 сентября, а его заместитель Хилков — 12 сентября. На их место как это явствует из дворцового дневника, был назначен Иван Васильевич Морозов: «того же месяца генваря … из Вязьмы послал государь к Москве, и велел ведать Москву, боярина Ивана Васильевича Морозова для того, что на Москве боярина князь Михаила Пронского не стало; а товарищи с боярином Иваном Васильевичем указал государь быть тем же, что были с боярином, с князь Михаилом Петровичем Пронским».
Положение в Москве становилось все тяжелее и тревожнее. Это грубоватыми, но четкими штрихами обрисовано в письме царицы к окольничьему Хилкову: «Писал ты к нам, что… бояре наши князь Михаиле Петрович Пронской, да князь Иван Васильевич Хилков умерли, сокольничий наш князь Федор Андреевич Хилков лежит болен, а ты себе ожидаешь смерти ж, а моровое поветрие на Москве на люди… учало быть больши прежнего, а Суздальской архиепископ Софроний умер, в монастырех и на монастырских подворьях, в Кремле, в Китае, и в Белом городе, и за городом архимандриты и игумены, и старцы, и старицы… попы и дьяконы и всякие церковные причетники померли многие… и служилые люди, дворяне и дети боярские городовые многие померли, а иные с Москвы съехали; а которые у наших дел были на Москве гости… и иные гостиные и суконные сотен торговые люди многие померли, и в таможне и на денежном дворе и у иных наших дел голов и целовальников нет, а выбрать некого, а в черных сотнях и в слободах жилецкие всякие люди померли ж многие, а осталась самая малая часть; а стрельцов шести приказов и с один приказ не остался, многие померли ж, и иные разбежались, а которые и осталось и те многие больны, а здоровых мест в городе и за городом слобод жилецких и стрелецких ничего нет, и ряды все заперти».
В городе начались грабежи: «А воровство де на Москве объявилось:
В Белом городе разграбили Филонов двор Оничкова, да Алексеев двор Луговского, да за городом разграбили Осипов двор Костяева и иные вы морочные пустые. Многие дворы грабят, а сыскивать про то воровство и воров унять некому. Да, по вашему государеву указу, для малолюдства велели запереть ворота… а у тех ворот на караулы стрельцов поста-нить некого и стоят без перемены толко человека по 3 и по 4, и те больны».
Павел Алеппский в своих заметках сообщает, будто по «точным» нычислениям «царского наместника и визирей», по спискам, число умерших в столице с начала эпидемии и до ее окончания равнялось 480 тыс. Москва, «прежде битком набитая народом, сделалась безлюдной… Собаки и свиньи пожирали мертвых и бесились, и потому никто не осмеливался ходить в одиночку, ибо, если бывало, одолеют одинокого прохожего, то загрызают его до смерти».
Все приказы в Москве закрыли. Дьяки и подъячие умерли или разбежались. Большую часть ворот также закрыли за отсутствием сторожей и стрельцов. По словам патриарха Макария, «царь послал сначала 600 стрельцов