Для понимания всей полноты жизни водоёма необходимо рассмотреть условия существования и возникновения самого водоёма, стабильность его, пределы обмеления или временного высыхания, степень замкнутости или проточности, периодичность возникновения; необходимо также изучение биоценозов в водоёме и истории их возникновения в связи с окружающей водоём наземной природой и в зависимости от влияния деятельности человека. Из этой сжатой характеристики явствует сложность проблемы, в которой ложно разобраться лишь рассматривая вопрос по частям.
Остановимся на ознакомлении с факторами, обусловливающими существование сложившегося в водоёме биоценоза. Ввиду чрезвычайного разнообразия водоёмов и населяющих их биоценозов вопрос ставится здесь в общей, синтетической форме, применительно к водоёму замкнутого характера. Его население состоит из бактерий, водорослей, высших водных растений, простейших, кишечнополостных (гидры), плоских червей (ресничные черви или планарии), кольчатых червей, мшанок, низших и высших ракообразных, водяных пауков и клещей, личинок, нимф и имаго насекомых с неполным и с полным превращением, из низших насекомых (Apterygota), моллюсков, рыб и земноводных хвостатых и бесхвостых. Ближайшее отношение к населению водоёма имеют водоплавающие птицы.
Биоценозу водоёма свойственен определенный видовой состав (структура биоценоза), разнообразие и обилие которого чрезвычайно вариируют, смотря по характеру водоёма и истории его заселения. Биоценоз, или сообщество водных обитателей водоёма или его определенной части, имеет свою историю. Последняя уходит в давнопрошедшее время для постоянных давно существующих водоёмов или протекает на наших глазах в водоёмах временного значения. В процессе эволюционного развития устанавливается более или менее определенный видовой состав биоценоза, который стабилизируется или, как говорят, находится в состоянии подвиж кого равновесия; оно касается как взаимоотношений сочленов биоценоза друг с другом, так и зависимости их и биоценоза в целом от факторов внешней среды.
Необходимо помнить, что наблюдаемый нами состав любого биоценоза является лишь этапом истории его существования; он, конечно, не стабилен в абсолютном смысле этого понятия, но сохраняет более или менее долго постоянство своего видового состава, если не происходит каких-либо особых изменений, например вторжения новых обитателей, нарушающих установившуюся зависимость сочленов биоценоза друг от друга, или колебаний факторов внешней среды, в количественном или в качественном отношениях выходящих за обычные пределы их амплитуды. Следствием таких изменений может явиться полный распад существовавшего ранее биоценоза или его явное видоизменение; последнее выражается в том, что один биоценоз сменяется другим, другой - третьим и т. д. Такое явление называется экологической сукцессией биоценоза. Темпы сукцессии вариируют от нескольких дней для временных водоёмов и до геологических сроков летоисчисления, если рассматривается история населения древних водоёмов. Особо выделяются сезонные сукцессии, то есть изменения состава биоценоза, связанные с переменою времен года. Например, зимою мы не найдем в составе биоценоза куколок комаров сем. Culicidae, различные виды их зимуют по разному - то в фазе имаго (Culex pipiens, Anopheles maculipennis), то в состоянии отложенных яиц (виды комаров рода Aedes). Некоторые же водные обитатели остаются вполне активными зимою подо льдом, например некоторые ветвистоусые рачки; но в их поколениях происходят изменения внешних признаков в связи с зимними изменениями свойств воды как среды их обитания (см выше данные о цикломорфозе дафний).
Биоценотические связи при обилии сочленов биоценоза представляют большую сложность, в которой нелегко разобраться. Поэтому целесообразно выделять ведущий сочлен биоценоза и уже по отношению к нему определять важнейшие взаимосвязи с прочими сочленами того же сообщества, а также и с биоценозами другого порядка, если между ними имеется какая-либо реальная связь (например, зависимость обитателей водоёма от наземных животных, для которых они служат пищей).