Отдельная тема большого исследования — масонство и декабристы. Действительно, большая часть декабристов — около 180 человек — были масонами (из 2 тысяч масонов империи), в их числе и руководители заговора. Но было ли восстание на Сенатской площади столицы "масонской работой". Скорее всего, что нет.
Дело в том, что масоны Российской империи в 1802–1822 годах стремились не к революции, а к постепенной эволюции режима. Некоторые лидеры масонства (де Ришелье, де Рибас и др.) были напуганы Французской революцией и ее политикой террора не меньше, чем император. Огромные силы и средства русское масонство тратило на воспитание нового поколения, что должно было постепенно привести Россию к прогрессу исключительно не насильственным путем. В то же время запрещение масонских лож в 1822 году подтолкнуло некоторых офицеров — масонов к изменению основного плана и к превращеню эволюционного — либерального движения в тайное общество военных — заговорщиков. Однако, поспешность, нетерпение и радикализм декабристов не разделялся руководством масонских лож.
Многие лидеры декабристов еще в 1818–1823 годах покинули масонские ложи, которые перестали удовлетворять их усилившемуся радикализму. Н. Пестель перестал посещать ложи в 1821 году, в 1820 году были исключены из списка членов ложи С. и М. Муравьёвы-Апостолы, Н. Муравьёв, И. Долгорукий, Ф. Шаховской… Очевидно, восстание декабристов произошло вопреки решениям "тайных" масонских лож Высших градусов, еще существовавших в 1825 году в империи. Вместе с тем "тайные" масоны заняли по отношению к "непутевым" декабристам странную позицию.
С одной стороны они официально клеймили "заблудших" заговорщиков и сотрудничали с Верховным уголовным судом, разбиравшем дело декабристов. Членами суда были масоны высших градусов: М. Сперанский, А. де Ланжерон, М. Виельгорский, Н. Мордвинов, А. Бенкендорф и др.
С другой стороны — масоны, участники суда над декабристами, вели дело так, чтобы не дать обнаружить таинственных "главных вождей заговора" и пресечь распространение информации о масонской системе, иногда — облегчить судьбу заговорщиков, сократить круг подозреваемых. Некоторые публицисты утверждают, что молодых масонов — декабристов судили их старшие "братья" — руководители более засекреченные, которые спланировали восстание и опасались откровенных показаний и лишней информации. Пестель и его "команда", якобы, отбились от руководителей более серьезного заговора, за что и были покараны.
21 апреля 1826 года одним из первых своих рескриптов на имя министра внутренних дел новый император России Николай I подтвердил запрещение деятельности масонских лож. А в начале 1826 года Николай Павлович пишет начальнику Главного штаба Дибичу: "По всему делу видно, что в Одессе должно быть гнездо заговорщиков". Почему центр, по мнению императора, находился в Одессе, остается загадкой…
В 1826 году в Одессе, как и во всей империи, прошла новая компания "поиска масонов", причем в своем масонстве признались и давали показания о своем участии в масонских ложах: Ж. Лоран и М. Калинеский, Г. Виард, Ж. Лоран, А. Пиллер… Но масоны продолжали работать в Ришельевском лицее — Дудрович проработал в нем до 1837 года, Виард и Пиллер — до преобразования лицея в Новороссийский университет. В то же время в 1822–1828 годах некоторые профессора — масоны самостоятельно покинули Ришельевский лицей или были уволены из лицея.
С 1828 года установился особо строгий полицейский надзор за деятельностью "тайных масонов". Полиция проводила многочисленные обыски, реквизицию масонских книг, бумаг и реманента, предупредительные задержания отдельных масонов. Из библиотеки Ришельевского лицея изымались и уничтожались "подозрительные книги". В ответ на это в масонских ложах империи было упразднено ведение протоколов заседаний, отменено всякого рода письменное делопроизводство и запись членов. Единственны ми документами, сохраняемыми в письменном виде, был устав, регламент русских лож и масонская Конституция. Эти документы тщательно хранились в тайниках и вынимались из них только для прочтения новому члену после его принятия в ложу.