Следующая гипотеза связывает «посмертное» существование бывшего шефа гестапо со Штази – органами безопасности ГДР. Министерство, которым руководил Вильгельм Цайссер (а позже – Эрнст Волльвебер и Эрих Мильке), было основано в 1950 году и просуществовало до 1989 года. На службу в эту организацию попало немало бывших служащих гестапо, которым предложили искупить свою вину, применяя профессиональные навыки на благо новой Германии. Альтернативой этому предложению был суд и суровый приговор, поэтому большинство охотно пошло на сотрудничество. Сторонники гипотезы указывают на невероятную эффективность Штази (спецслужба занимала третье место в мире после КГБ и ЦРУ). По их мнению, быстро развернуть сеть осведомителей внутри страны и завербовать многочисленную агентуру за рубежом можно было только под руководством опытного консультанта, на роль которого идеально подходил Мюллер. Ему были известны имена и клички всех агентов, а также личные характеристики многих из них. Огромный опыт позволил бы Мюллеру быстро наладить работу министерства и сделать ее максимально организованной. Учитывая, что деятельность Штази происходила под жестким контролем КГБ, использование опыта бывшего начальника криминальной полиции возможно было только с разрешения Москвы. Если Мюллер был принят советской разведкой и получил прощение за прошлые грехи, передавая СССР важные данные, ему могли бы поручить создание новой структуры. Однако в этом случае существовал риск опознания его случайными свидетелями – мелкими служащими или доставленными на допрос гражданами. Полностью исключить контакты с внешним миром едва ли было возможно, да и Мюллер вряд ли согласился бы на подобные условия. А утечка информации привела бы к громкому скандалу и неминуемой выдаче нацистского преступника. Кроме того, в работе шефа гестапо важную роль играл личный контакт с подчиненными. Он умел оценить способности того или иного человека после небольшой беседы. Без личного контакта «баварский лис» мог предложить лишь общие рекомендации – но они были бы ничуть не лучше тех, которые могли дать кураторы из КГБ.
Журнал «Штерн» в 1964 году напечатал цикл статей, посвященных Мюллеру. В статьях (со ссылкой на неофициальные источники) утверждалось, что первые десять лет после войны группенфюрер провел в Москве, раскрывая Берии секреты нацистов, а позже был переправлен в Албанию под новым именем – Абедин Бекир Накошири. Журналист был убежден, что этот человек занимался разработкой зарубежных операций албанской разведки. В 1967 году информацию о том, что Мюллер вышел на пенсию и живет в Тиране на вилле «Горис», напечатала газета Neue Ruhrzeitung, а позже те же сведения появились в научно-популярной «Иллюстрированной истории движения сопротивления в Германии и Европе». Эта версия долгое время была популярна, однако сложно представить, что результаты журналистского расследования не перепроверили профессионалы из «Моссад», ЦРУ или КГБ.
В разные годы следы Мюллера пытались отыскать почти во всех частях света: Европе и Азии, обеих Америках, Антарктиде. Но возможно, он перехитрил всех и скрылся там, где его никто не стал бы искать? Например, на одном из островов Тихого океана, в Австралии или одной из арабских стран?
Арабский Восток долгое время был предметом пристального внимания нацистской Германии. Парижский адвокат Серж Класерфельд, получивший известность благодаря поискам Бруннера в Сирии, сумел найти немало доказательств тесных контактов Третьего рейха с видными деятелями Сирии, Ирака, Саудовской Аравии, Египта. Одним из активных сторонников Гитлера в еврейском вопросе был великий муфтий Иерусалима Хадж Амин аль-Хуссейни, еще в 1933 году установивший контакт с Берлином. Известно, что муфтий получил от Германии военную и финансовую поддержку при осуществлении еврейских погромов в Палестине в 1936 году, позже побывал в немецких концлагерях. Хадж Амин аль-Хуссейни был внесен в список нацистских преступников, поскольку занимался созданием мусульманских формирований в составе СС.
Представители правящих кругов Германии также совершали поездки в арабские страны. В частности, в 1937 году на Восток отправился руководитель гитлерюгенда Бальдур фон Ширах, двумя годами спустя в Каир прилетел Йозеф Геббельс, а перед самым началом войны – Адольф Эйхман. На внедрение гитлеровской агентуры в арабских странах ежемесячно выделялось 75 000 марок, и к моменту окончания войны пронацистские настроения там были очень сильны.