20 июня 1998 года была образована комиссия Государственной думы по отрешению президента от должности. За создание комиссии проголосовали 300 депутатов, против — 3, воздержавшихся не было. В комиссию были направлены представители всех фракций и парламентских групп (комиссия сформирована в соответствии с регламентом, предусматривающим пропорциональный принцип ее создания). Председатель комиссии — В. Филимонов (КПРФ), заместитель — Е. Мизулина (фракция «Яблоко»).
2 июля 1998 года главе государства было направлено письмо с извещением о начале работы комиссии и сообщено, что комиссия готова выслушать президента или представителя президента на своих заседаниях.
6 июля 1998 года состоялось первое заседание комиссии Государственной думы по проверке выдвинутых против президента России Б. Ельцина обвинений. Согласно «Обоснованию постановки вопроса об отрешении президента от должности» Б. Ельцина обвиняли в государственной измене — ст. 75 УК (подписание Беловежского соглашения, развал Вооруженных Сил), государственном перевороте — ст. ст. 278, 280, 105 и 186 и другие статьи УК (штурм Белого дома в 1993 году), превышение должностных полномочий — ст. 286 УК, ст. ст. 15 и 102 Конституции РФ (война в Чечне) и геноциде — ст. 357 УК (последствия экономических реформ).
27 июля 1998 года комиссия по импичменту провела первые публичные слушания по первому пункту обвинения в адрес президента — неправомерность подписания Б. Ельциным Беловежских соглашений о ликвидации СССР.
На очередном заседании комиссии 17 августа 1998 года были проведены слушания, посвященные второму пункту обвинений, выдвинутых против президента. Одновременно рассматривался законопроект «О гарантиях гражданину, исполнявшему должность президента РФ», в котором оговаривались привилегии бывшему президенту.
21 августа 1998 года 248 депутатов Госдумы проголосовали за постановление «О рекомендации президенту РФ Б. Н. Ельцину досрочно прекратить исполнение президентских полномочий и уйти в отставку» (против постановления проголосовали 32 законодателя). 28 сентября 1998 года в Госдуме были проведены слушания, касавшиеся третьего пункта обвинений в адрес главы государства (война в Чечне). 14 октября парламентская комиссия по импичменту приняла в целом заключение по третьему пункту обвинений депутатами главы государства — «начало чеченской войны».