Подавление булавинского восстания имело далеко идущие последствия. Царская власть на Дону усилилась. В декабре 1708 года донские земли были включены в состав Азовской губернии. Количество русских крепостей на казачьих землях возросло. Коменданты крепостей получили право решать как споры между казаками, так и споры казаков с соседними народами. Роль войскового круга в управлении казачьими делами постепенно угасала. Важнейшую его прерогативу, избирать войскового атамана, Петр I присвоил себе, и далее атаманы назначались уже только из центра. В 1721 году казаков вывели из-под управления Коллегии иностранных дел и подчинили Военной коллегии. Казачьи земли окончательно перестали считаться зарубежными территориями, а казаки стали нести военную службу в регулярной армии. Все эти меры лишили казаков самостоятельности и интегрировали их в структуру зарождавшейся империи.
Усиление центральной власти на Дону привело к уменьшению грабительских походов. Царские указы, гарнизоны и войска надежно связали руки предприимчивых казаков. Теперь любой разбойничий выход своевременно пресекался изнутри. Если после разинского восстания донские казаки оказались существенно ограничены в передвижениях за пределы своего края, то после булавинского бунта казачья жизнь на Дону была целиком подчинена царской власти. Москва постепенно прибрала к рукам все ниточки управления некогда свободной территории. Судьбе своих донских соратников последовали яицкие казаки.
Заселение берегов Яика казаками происходило в конце XVI века, когда часть волжских казаков бежала сюда, спасаясь от царских войск и правительственного давления. В 1577 году Иван Грозный снарядил на Волгу отряд стрельцов во главе с Иваном Мурашкиным, которому приказал: «Где бы он тех воров-казаков ни застал, велел их пытать, казнить и вешать». Жесткая государственная политика вынудила казаков переселиться на другое, более безопасное место. В 1580-х гг. они основали свои первые поселения на Яике. Столицей яицкого казачества на долгие годы вперед стал Яицкий городок. В 1613 году яицкие казаки обратились к царю Михаилу Федоровичу с челобитной о принятии их в русское подданство. Царь принял прошение и в 1615 году пожаловал царскую грамоту «на владение рекою Яиком, с сущими при ней реки и притоки, и со всеми угодьями с правой и левой стороны, начиная от впадения реки Илека и до устья» с дозволением «набираться на житье вольными людьми».
Несмотря на подчинение центральной власти, яицкие казаки еще долгое время сохраняли самостоятельность во внутренних делах. Вольность в решении насущных вопросов позволяла им планировать и совершать грабительские походы. Так, яицкие казаки участвовали в «походе за зипунами» в Персию в составе отряда Степана Разина. В 1677 году отряд из 300 казаков напал на Гурьевский городок в устье Яика и разграбил местные склады. Между тем влияние московских порядков только усиливалось: яицкие казаки участвовали в военных походах в составе царских отрядов, охраняли границы русского государства от набегов степных кочевников.
При Петре I государственная служба яицких казаков стала носить более постоянный характер. Они принимали участие во взятии Азова и сражениях со шведами. Выполняя царский указ, в 1717 году они в составе крупного войска предприняли неудачный поход в Среднюю Азию с целью склонить Хивинское ханство к русскому подданству. В 1721 году указ Петра I о переподчинении казаков Военной коллегии на Яике был встречен враждебно. Ситуацию усугубили решения царя о возврате беглых с казачьих территорий и назначении атамана волею царя. Вспыхнул бунт, который был жестоко подавлен. С этого момента яицкое казачество внешне целиком подчинилось царской власти, а внутри наметился раскол. Казаки разделились на тех, кто поддерживал новые порядки, и тех, кому они не нравились. Озлобленность последних со временем только возрастала, пока не случилось непредвиденное.