В отношении последнего – влияния микробиома на последствия вирусных проникновений в организм – вопрос, казалось бы, решается весьма однозначно: нормальная (что бы под этим ни понималось) микробиота способствует формированию крепкого (чтобы это слово ни значило) иммунитета, крепкий иммунитет способен успешно противостоять большинству вирусных инфекций. И в самом деле показано, что кишечная микрофлора решающим образом способствует формированию иммунной зрелости лимфоидной ткани, ассоциированной с ЖКТ (Karst S. M.,
2016). Напротив, лишенные микрофлоры животные («стерильные» или гнотобионты) оказываются чрезвычайно чувствительными к кишечным патогенам любого рода в силу незрелости лимфоидных органов в своем кишечнике (Hooper L V. et al., 2012; Kamada N. and Nunez G., 2014). Помимо поддержки созревания лимфоидной ткани, кишечные бактерии могут содействовать иммунному развитию иммунного ответа уже непосредственно в ходе инфекции.Продемонстрировано, например, что широко известные пробиотические лактобактерии рода Lactobacillus эффективно подавляют репликацию мышиного норовируса в культуре клеток, стимулируя выработку интерферонов альфа и бета (Lee H. And Ko G., 2016). При вирусных инфекциях для быстрого развития адаптивного иммунного ответа часто не хватает контекстной верификации опасности, которой должно подтверждаться обнаружение вирусных антигенов (БОН: глава XIII).
Такое подтверждение может давать собственная микрофлора. Например, при кишечной ротавирусной инфекции необходимую активацию образ-распознающих рецепторов (pattern recognizing receptors, PRRs
) – сигнальщиков неблагоприятного инфекционного контекста – обеспечивают белки жгутиков (флагеллины) кишечной микрофлоры. Стимуляция ими двух видов PRR на поверхности кишечного эпителия (TLR5, toll-like receptor 5-толл-подобные рецепторы 5-го типа и NLRC-4) вызывает интенсивную выработку интерлейкина-22, запускающего каскад апоптического самоуничтожения инфицированных ротавирусом соседних клеток, и интерлейкина-18, инициирующего пролиферацию эпителия, возможно, компенсаторную (Zhang B. et al., 2014). Схожим образом при ротавирусной инфекции пробиотические бактерии Bifidobacterium brevis в смеси с пребиотическими олигосахаридами способны усиливать иммунный ответ на ротавирус через активацию TLR2, стимулирующее образование в кишечном эпителии цитокинов интерлейкин-4, гамма-интерферон, TNFα и вывод иммунных клеток из состояния толерантности к вирусу (Rigo-Adrover M. del M. et al., 2018).Аналогичные механизмы задействованы при респираторных вирусных инфекциях. При гриппе золотистый стафилококк, условно-патогенный обитатель носоглотки, стимулирует созревание периферических моноцитов в иммунокомпетентные противовирусные альвеолярные макрофаги через активацию тех же толл-подобных рецепторов TLR2
(Wang J. et al., 2013), а коринебактерия C. pseudodiphtheriticum из верхних дыхательных путей при респираторно-синцитиальной инфекции аналогично активирует рецепторы TLR3, обеспечивая усиленное размножение Т-клеток, вырабатывающих провоспалительные цитокины с противовирусным действием – интерлейкин-6, гамма- и бета-интерферон, TNFα (Kanmani P. et al., 2017). Неудивительно, что схожим действием обладает и вагинальная микрофлора, представленная лактобациллами: при ее отсутствии, например в результате антибиотикотерапии, возрастает восприимчивость к генитальной герпетической инфекции (Oh J. E. et al., 2016). Более того, положительное влияние бактериальной микрофлоры (в первую очередь кишечной) не ограничивается местом ее локализации, оно может распространяться на другие удаленные слизистые оболочки организма. Такая общая защитная противовирусная функция кишечной микрофлоры, как показано к настоящему времени, в основном на примере вируса гриппа А, может реализовываться несколькими механизмами:1. Через стимулирование выработки секреторных иммуноглобулинов А, способных связывать вирусы на поверхности слизистых оболочек (Ichinohe T. et al.,
2011).