В последние годы жизни Петра I Толстой все больше предпочтения отдает именно светской жизни и другим государственным делам. Ведь в петровской империи помимо руководства Тайной канцелярией Петр Андреевич был одним из первых управленцев, занимая еще несколько важнейших государственных постов, в частности возглавляя Коммерц-коллегию и будучи одним из председательствующих в Сенате. Можно ли сегодня в современном государстве представить главу спецслужбы, одновременно являющегося министром экономики своей страны и спикером ее парламента? Тогда же такое оригинальное совмещение постов было почти нормой и не только в России. Собратья Толстого по руководству зарубежными тайными полициями, де Брюль во Франции или Альберони в Испании, кроме этого имели массу других должностей в своих королевствах, являясь первыми советниками своих монархов и возглавляя внешнеполитические ведомства своих государств. И можно ли современного главу спецслужбы представить одновременно в роли посла своего государства за границей и частного бизнесмена? А Толстой, оставаясь главой Тайной канцелярии, выезжал в 1719 году на полгода в Берлин во главе российской делегации для переговоров с Пруссией о военном союзе. В 1722 году он же был главой походной канцелярии в армии Петра в Каспийском походе, и в эти же годы Толстой владел суконной частной фабрикой, пытаясь производить отечественные шелка. Фабрика эта, впрочем, к 1722 году прогорела и закрылась, не давая прибыли, даже в XVIII веке оказалось невозможным быть одновременно главой тайной полиции, послом, сенатором и преуспевающим коммерсантом.
Начиная с 1722 года Толстой заседаниям в Сенате и Коммерц-коллегии уделяет все больше времени, в офисе Тайной канцелярии в его все более частые отлучки всем распоряжается его заместитель-асессор Андрей Ушаков. В 1724 году Толстой даже подает императору официальное прошение об отставке с поста главы Тайной канцелярии, пытаясь сосредоточиться на работе в Коммерц-коллегии, но его просьба Петром отклонена. То есть поначалу царь согласился с отставкой Толстого для работы его только в Сенате и Коммерц-коллегии, в январе 1724 года Петр даже приказал новых дел Тайной канцелярии не принимать и подготовить все старые дела и арестованных, за ней числящихся, для передачи в Сенат. Скорее всего, Петр хотел модернизировать свой сыск уже тогда, создав взамен канцелярии новый орган тайного сыска под контролем Сената и генерал-прокурора, а на Толстого возложить только кураторство за этим сыском со своего высокого поста в Сенате. Возглавить саму новую спецслужбу, скорее всего, пришлось бы уже Андрею Ушакову.
Позднее все так и будет, и Ушаков посидит в кресле главы русского тайного сыска, и внук Петра I Петр Федорович при очередном закрытии Тайной канцелярии в 1762 году тоже прикажет все ее дела сдать в Сенат. Но в 1724 году Петр почему-то передумал или забыл о своей инициативе за более важными государственными делами. В Тайную канцелярию вновь поступали дела и везли колодников, а Толстой продолжал разрываться между Петропавловскими казематами и Сенатом, стоящими на разных берегах Невы. А вскоре сам его благодетель-самодержец умирает, и извилистая линия судьбы Толстого сама освобождает его от утомительных обязанностей многоликого министра.
РЕПРЕССИРОВАННЫЙ ИНКВИЗИТОР
После смерти Петра в начале 1725 года спираль биографии Петра Толстого начинает закручиваться к своему началу: он опять становится заговорщиком и участником борьбы за трон. Когда еще у постели умирающего Петра птенцы его гнезда разбились на две придворные группировки, у Толстого выбора не было. Он примкнул к тем, кто потребовал возведения на престол вдовы покойного императора Екатерины I, вместе с Меншиковым, Бассевичем и Бутурлиным составив штаб этой группы и руководя этим мини-переворотом в осиротевшей империи. К той группе петровских выдвиженцев, которая под руководством Голицына и Репнина требовала на царство малолетнего внука Петра и его полного тезки Петра Алексеевича, Толстому хода никак не было — царевич знал, кто руководил розыском и убийством его отца Алексея. Кроме того, партии «за Екатерину» и «за Петра» сложились автоматически. За маленького внука покойного царя стояла старая русская знать под началом Голицына, Долгорукого, Апраксина и Репнина, надеявшаяся свернуть слишком европейский крен реформ Петра на более спокойную и национальную дорогу. Поэтому Толстой, как и другие «выскочки» петровского окружения из мелких дворян, иностранных авантюристов и детей московских пирожников или литовских свинопасов (Меншиков, Бассевич, Девиер, Ягужинский и др.), немедленно собрались в противоборствующую партию сторонников продолжения петровского дела. А взятая царем в жены бывшая ливонская прачка Марта Скавронская (Екатерина после крещения в православие) в этом смысле была самым настоящим их символом и последней надеждой этих людей.