После боя у острова Самар остатки японского флота, преследуемые американской авианосной авиацией, отходили из районов боя. Часть отставших поврежденных японских кораблей была добита и пошла ко дну. 27 октября Тойода приказал Миве выслать часть подводных лодок в залив Ламон (остров Лусон) с задачей атаковать американские авианосцы, авиация которых наносила удары по японским воздушным базам в северной части Лусона. Остальным подводным лодкам было приказано занять позицию в районе Лейте с задачей уничтожения сил, перебрасываемых для усиления группировки противника в этом районе. Подводные лодки "RO-112" и "RO-109" вышли из пролива Бунго в последних числах октября. В их задачу входило присоединиться к трем лодкам того же типа, развернутым на позициях в районе залива Ламон.
5 ноября подводной лодке "I-38" было поручено произвести разведку в районе островов Нгулу, расположенных к юго-западу от островов Улити, и доложить результаты не позднее 13 ноября. Следуя на выполнение задания, она донесла об обнаружении оперативного соединения противника, и после этого связь с ней прекратилась. 8 ноября Мива приказал большей части подводных лодок вернуться в Японию. На патрулировании остались "RO-109" и "RO-112" в районе севернее острова Самар и четыре лодки типа "I", как полагал Мива, — в районе Лейте. Но, как говорилось выше, две из них были потоплены, одна ушла для ведения разведки в районе Нгулу, а у Лейте находилась лишь "I-53".
Таким образом, развернутые к востоку от Филиппин пять японских подводных лодок типа "RO" в период проведения десантной операции на острове Лейте контакта с противником не имели и возвратились в Японию ни с чем. Некоторого успеха добились восемь лодок типа "I". Они потопили сторожевой корабль и повредили эскортный авианосец и легкий крейсер. При этом были потеряны шесть японских лодок из восьми. Мива мог успокаивать себя только преувеличенными донесениями об успехах своих лодок и тем, что потери в лодках этих дней ниже потерь, понесенных Японией при ведении американцами операции против Марианских островов. Однако весьма высокий процент потерь заставил японское командование задуматься о целесообразности использования в подводной войне обычной тактики. Этому в значительной мере способствовал успех и популярность авиации корпуса "камикадзе". К тому же в течение некоторого времени в Японии уже велись работы по созданию управляемого смертниками оружия.
В октябре имели место два события, которые насторожили американские силы ПЛО, В конце сентября командование Объединенного флота приказало Миве выслать "I-12" для действий против судоходства у западного побережья США и в районе Гавайских островов. 4 октября "I-12" вышла из базы и, пройдя Сангарский пролив, направилась к западному побережью США. На переходе лодка строго соблюдала радиомолчание. О ее появлении стало известно 29 октября, когда она потопила американское судно в районе между Гавайскими островами и Сан-Франциско. Это сообщение привело в смятение американские силы ПЛО. Восточная часть Тихого океана была так долго свободна от подводных лодок противника, что появление здесь японской лодки казалось просто невероятным. И надо было так случиться, чтобы лодка появилась именно в тот момент, когда все корабли охранения были заняты обеспечением коммуникаций, по которым шло снабжение американских сил в западной части Тихого океана[73]
.До октября 1944 года районы действий немецких и японских подводных лодок в Индийском океане были географически разграничены. Немецкие лодки использовали японскую базу в Пенанге, но вели боевое патрулирование в своем районе и только иногда появлялись севернее Малайского барьера. Но 6 октября голландская подводная лодка "Звардвис" потопила немецкую "U-168" в Яванском море, взяв в плен командира и штурмана. Означало ли нахождение в этом районе немецкой подводной лодки, что Германия намерена принять участие в военных действиях на Тихом океане, — сказать трудно. Та же голландская лодка 17 октября потопила японский минный заградитель "Ицутсима".
В начале октября "волчья стая" в составе "Эсколара" (командир Милликан), "Кроукера" и "Перча" прибыла в Желтое море. Из-за отсутствия противника Милликан, командовавший стаей, 17 октября передал "Перчу", что "Эсколар" уходит в район Нагасаки. Больше об "Эсколаре" не слышали. В районе, куда ушел он, имелись минные заграждения, о чем Милликан знал, и переданный им на "Пёрч" маршрут "Эсколара" не проходил ни через одно из известных минных заграждений. Истинные причины гибели "Эсколара" неизвестны. Скорее всего, он подорвался на мине.