В годы войны наше подразделение стало главным центром разведывательно-диверсионной деятельности органов госбезопасности в тылу противника. Ему принадлежит важная роль в инициировании и развертывании массового партизанского движения в тылах фашистской армии. Во исполнение Постановления ЦК ВКП (б) и правительства «Об организации борьбы в тылу германских войск» и в первый период войны именно на базе четвертых отделов НКВД возникли первые партизанские отряды и истребительные группы. Особую роль наш аппарат сыграл в организации конспиративного обеспечения массового партизанского движения в Белоруссии, Прибалтике, на Украине. Вместе с тем, как следовало из Директивы НКВД СССР от 13 июля 1942 года, штабам партизанского движения не подлежали передаче разведывательно-диверсионные группы специального назначения, действовавшие в тылах противника, разведывательная агентура, курьеры и связники, резиденты в немецком тылу, а также переписка по партизанским формированиям (сводки, донесения, доклады, радиограммы и т. д.).
Именно эту громадную боевую работу, базируясь на сплошных клеветнических измышлениях и фальсификациях, стремятся представить в искаженном виде ваксберги, бобреневы, рязанцевы, петровы и прочие очернители героической борьбы наших разведчиков с фашизмом.
В тыл врага было направлено более двух тысяч оперативных групп общей численностью 15 тысяч человек. Двадцать три наших офицера получили высшую правительственную награду — им присвоили звание Героя Советского Союза. Более восьми тысяч человек наградили орденами и медалями. Маршалы Жуков и Рокоссовский специально обращались в НКВД с просьбой о выделении им отрядов из состава 4-го управления НКВД для уничтожения вражеских коммуникаций и поддержки наступательных операций Красной Армии в Белоруссии, Польше и на Кавказе. Подразделения 4-го управления и Отдельной мотострелковой бригады особого назначения уничтожили 157 тысяч немецких солдат и офицеров, ликвидировали 87 высокопоставленных чиновников, разоблачили и обезвредили 2045 агентурных групп противника. Руководить всеми этими операциями поручено было мне и Эйтингону. В истории НКВД это, пожалуй, единственная глава, которой продолжают гордиться его преемники. На всех официальных мероприятиях, посвященных очередной годовщине битвы под Москвой и Сталинградом, а также освобождению Белоруссии, всегда упоминают имена партизан и подпольщиков, находившихся под нашим командованием. Кузнецов, Медведев, Прокопюк, Ваупшасов, Карасев, Марковский, Прудников, Шихов, Кудря, Лягин для наших людей — герои сопротивления фашизму на оккупированных территориях. С 1945 по 1992 год у нас издано приблизительно пять тысяч книг и статей о боевых операциях Особой группы 4-го управления в Великой Отечественной войне. В эти годы я находился на действительной службе, затем был арестован, заключен в тюрьму, наконец, освобожден и реабилитирован. И ни в одной из этих публикаций вы не найдете моего имени. Там, где на документах стояла моя подпись, появилось многоточие. Сначала меня не упоминали по соображениям секретности, а позднее мое имя изымалось, поскольку я являлся осужденным преступником и нежелательным свидетелем. Думаю, что нет необходимости останавливаться на известных подвигах бойцов и офицеров, сражавшихся вместе со мной в годы войны. В сборниках под моей редакций, изданных в 1970–1992 годах, названо более трех тысяч имен героев, воевавших в Отдельной мотострелковой бригаде особого назначения. Мне хотелось лишь остановиться на важнейших операциях советской разведки, рассказать о героях тайной войны, о которых мало знают, но которые сыграли заметную роль в военно-политических событиях того времени. Принципиально важно сейчас преодолеть конъюнктурные подходы к оценке роли органов госбезопасности в организации партизанского движения. Фактически именно они на первом этапе до образования Центрального штаба партизанского движения сыграли в его становлении главную координирующую роль. Этот тезис вызывает резкие возражения историков КПСС и войны, которые намеренно или по незнанию игнорируют архивные документы органов госбезопасности. Не хочу называть имен, но имею весомые основания утверждать, что почти все видные партизаны и подпольщики действовали в тылу врага в качестве особо доверенных, лиц органов НКВД — НКГБ, особенно в 1941–1942 годах, опираясь на нашу проверенную агентуру.
Именно НКВД СССР (Берия) вошел с ходатайством в ГКО в мае 1942 года о присвоении впервые высшего звания Героя Советского Союза выдающимся командирам партизанских отрядов тогда мало кому известным С. А. Ковпаку, И. И. Копенкину (сотрудник НКВД), А. Н. Сабурову (сотрудник НКВД) и А. Ф. Федорову 18 мая 1942 года Указом Президиума Верховного Совета СССР это звание было им присвоено. Кроме того, по тому же ходатайству НКВД были награждены орденами и медалями более 190 человек, которые сражались в партизанских отрядах под руководством этих командиров. В 1942 году характер борьбы на коммуникациях в тылу врага резко изменился.