К удивлению общественности, Тейлор после победы не появился в Вашингтоне, а до конца января следующего года оставался на западном побережье, командуя там войсками. В то же время он с помощью писем, а иногда отправляя своих эмиссаров, сформировал правительство, которое повсеместно признавалось как кабинет умиротворения. В него не был включен ни один из известных вигов. В кабинет вошли три южанина и три северянина, причем ни один из южан не занимал экстремистских позиций. Седьмое и главное место в правительстве — госсекретаря — досталось сенатору Джону Клейтону — из крохотного штата Делавэр, находившегося как раз посередине между Севером и Югом.
Вступив на высший пост в начале марта 1849 г., Тейлор стремился проводить курс сохранения рабовладельческого хозяйства на Юге в сочетании с полным прекращением владения рабами на новых территориях Запада. Ему удалось сохранять добрые отношения с аболиционистами Нью-Йорка, вести дружеские дискуссии с известным в то время борцом за полную отмену рабства сенатором Уильямом Суардом, одним из основателей новой Республиканской партии, которая в центр внимания поставила именно проблему отмены рабства. В то же время бывшему мужу своей скончавшейся дочери Джефферсону Дэвису, становившемуся одним из лидеров наиболее воинственных рабовладельцев, он говорил, что в случае необходимости будет «мечом защищать» существовавший порядок на Юге. Многим такая позиция казалась беспринципной, искусственной, и в значительной степени это было так, особенно имея в виду и то, что Тейлор до президентства не был политиком, и то, что он стал во главе государства благодаря силам, стремившимся к статус-кво.
Политику примирения Тейлор проводил и в отношении индейских племен. В ряде случаев местные инциденты с индейцами вызывали крайнее обострение обстановки в местах расселения племен, в частности во Флориде (где сохранялись семинолы) и Нью-Мексико (где проживало племя навахо). Хотя генералы призывали к жестокому подавлению возникавших бунтов, президент отклонял их требования, настаивая на сохранении мира. Обычно возникавшие конфликты удавалось разрешить, не прибегая к массовым репрессиям.
Столь же умеренный курс, рекомендуемый советниками и министрами, Тейлор проводил во внешней политике. Его правительству удалось заключить несколько договоров с образовавшимися в последние десятилетия центральноамериканскими государствами. Один из них предусматривал строительство канала, на территории Никарагуа, который соединил бы Атлантический и Тихий океаны. Предполагалось, что сооружение канала будет осуществлено совместно с Великобританией. Проект не был реализован, но породил дискуссии по поводу наиболее удобного района осуществления этого масштабного проекта, который в конце концов привел к созданию Панамского канала.
Внимание многих состоятельных американцев в это время все чаще обращалось на остров Кубу, находившийся всего в 150 км от Флориды. Остров, являвшийся испанской колонией, был богат природными ископаемыми, удобен для создания плантаций сахарного тростника. Зрели идеи проникновения на остров. На самом острове в среде местной элиты также возникло движение за присоединение к США как к стране с более развитой экономикой и большими коммерческими возможностями. В 1850 г. вспыхнуло восстание под руководством губернатора одной из провинций Нарсисо Лопеса, на помощь к ним из Флориды направилась группа американцев, преимущественно военных авантюристов. На юге США развернулось движение за масштабное вторжение на Кубу, но Тейлор, руководствуясь как собственным военным опытом, так и политической ориентацией на умеренность во внешних делах, отказался их поддержать. Восстание было подавлено, а Лопес казнен испанцами. Более того, по распоряжению президента в США было открыто уголовное дело против тех, кто поддерживал Лопеса. Правда, они были оправданы, но сами намерения Тейлора вызвали одобрение испанской монархии, отношения с которой улучшились.