Тем временем в Балтийском Поморье события разворачивались по иной схеме. После фактического распада империи Карла Великого в 840–843 гг. феодалы восточно-франкских областей стали главным врагом славян в Поморье и Прибалтике. Поначалу вооруженная борьба между ними шла с переменным успехом, однако к XII–XIII вв. славянские земли Полабья одна за другой были поглощены немцами и приняли христианство римского образца. Среди немногих, кому удалось сохранить, хотя бы отчасти, славянский язык и культуру, оказались лужичане – западнославянский народ, проживавший на территории Лужицы (региона, расположенного на территории нынешних немецких земель Саксония и Бранденбург, а также юго-западной Польши).
Эпизодические междоусобицы не мешали новгородцам и псковичам объединяться между собой, а также с русскими княжествами в противостоянии экспансии Западной Европы в Прибалтике.
Интересно отметить, что древние латыши называли русских «криеви» (krievi) – по аналогии с кривичами. Поэтому неудивительно, что в латышском языке некоторые самые древние слова хотя и заимствованы из древнескандинавского или древнегерманского, но имеют старославянское произношение.
В конце XII века в борьбу за обладание Эстонией активно включилась и Дания. Ее короли Вальдемар I Великий, Кнуд VI и Вальдемар II Победоносный превратили Данию в грозную балтийскую морскую державу, а король Кнуд VI проводил военные походы не только в Померании, но и в Финляндии, а также на территории нынешней Эстонии.
В XII веке, несмотря на неоднократные русские военные походы, продолжавшиеся целое столетие, эстонцы все же смогли отстоять свою независимость. Удалось отбиться от русских и земгалам, а также курам. А вот районы Западной Двины и Восточной Лифляндии в XI веке надолго подпали под господство восточных правителей. Так латыши (латгалы) из Талавы и Адзеле платили дань Пскову, восточные латгалы – Полоцку, а в замках Ерсика и Кокнесе на Западной Двине сидели зависимые от полоцкого великого князя потомственные русские князьки, взимавшие дань с летгалов и осуществлявшие набор рекрутов в войско. Ливы же на Западной Двине являлись данниками непосредственно Полоцка.
Начатое им дело решил довести до успешного конца сменивший его на престоле брат Вальдемар II. В 1218 году к нему обратился епископ Риги с просьбой о помощи против эстов, нападавших на немецких колонистов. Он дал согласие и вскоре получил поддержку от папы римского.
Папа Гонорий III в своей булле от 9 октября 1217 года благословил это дело и передал королю Дании все земли, которые тот захватит в Эстонии, что придало вторжению статус Крестового похода против прибалтийских язычников.
15 июня 1219 года была одержана победа над эстами при Линданисе.
Около 2000 эстов внезапно атаковали датчан, окружив их и нанося удары одновременно со всех сторон. Неожиданность нападения ошеломила крестоносцев, обратив их в бегство, но датчан спасла быстрая реакция князя Вислава I Рюгенского, который организовал контратаку и задержал эстов, дав основным силам время перегруппироваться. В итоге язычники были разбиты наголову и потеряли более тысячи человек.
Победа при Линданисе фактически означала завоевание Эстонии датчанами. Разгром эстов позволил крестоносцам основать герцогство Эстляндское, просуществовавшее вплоть до середины XIV века. На месте разрушенного Линданисе было построено укрепление, на базе которого позднее вырос город Ревель (ныне Таллин).