Российско-бухарский договор 1868 г. был дополнен новыми статьями 28 сентября 1873 г. К Бухарскому эмирату возвращались захваченные царскими войсками хивинские земли на правобережье Амударьи и припамирские бекства.
В 1876 г., после восстания, Кокандское ханство было ликвидировано, а его территория под названием Ферганской области было присоединена к Российской империи. В 1884 г. царские войска заняли Мерв и Кушку. Это был завершающий этап в завоевании Россией Среднеазиатских ханств[225].
В Бухарском эмирате проживало таджикское и узбекское население. До начала второй половины XIX в. территория была разбита на отдельные феодальные уделы (Гиссар, Куляб, Каратегин, Дарваз и др.). Они лишь номинально подчинялись бухарскому эмиру[226].
После восстаний Е. И. Пугачева в 1772–1775 гг. и Срыма Датова в 80–90-х гг. XVIII в. казахи Младшего жуза ушли к р. Сырдарье и северным берегам Каспийского моря, вытеснив туркменов, принявших в 1794 г. подданство России.
В 1863 г. в Петербург прибыли посланцы от хивинского хана Темира-гази с просьбой о ежегодной присылке в апреле российских судов на Мангышлакскую пристань для перевозки хивинских товаров в Астрахань. На эту просьбу последовало согласие с российской стороны, но при условии безопасного проезда для российских купцов в Хиву и права свободной торговли для них.
Несмотря на переговоры русско-хивинские отношения ухудшались. Постройка Раимского укрепления вызвала усиление хивинских набегов на казахов правого берега Сырдарьи. Их поддержали кокандцы. Военное министерство России приняло решение занять низовья Сырдарьи и овладеть Ак-Мечетью. В 1853 г. крепость была взята штурмом и переименована в форт Перовский. Началось строительство Сырдарьинской линии укреплений, включавшее форт № 1 (с 1864 г. г. Казалинск), форма № 2 в урочище Кармакчи, форта № 3 на р. Кувандарье и форта Перовского[227].
В 1860 г. в Семиречье вновь начались военные действия против кокандцев, в результате которых были взяты Токмак и Пишпек. В 1861 г. были взяты Джулек и Яны-Курган на Сырдарье. Встал вопрос о соединении в одну линию укреплений на Сырдарье и в Семиречье, разделенных владениями кокандцев. С этой целью в 1864 г. были взяты Н. А. Веревкиным г. Туркестан, а М. Г. Черняевым – Аулие-Ата и Чимкент[228].
В 1859 г. была организована экспедиция полковника Генерального штаба России Дандевиля, в результате которой были подготовлены условия для присоединения новых районов Туркмении. К середине XIX в. подданство России признали 11500 прикаспийских туркмен-иомудов, чоудоров, абдалов, игдыров.
Полковник Дандевиль оставил описание кочевой территории туркменских племен: «Местность, по коей кочует туркменский народ, заключается между берегом Каспийского моря, персидской и бухарской границей р. Аму-Дарьи и южной оконечностью Усть-Урта. Это пространство пустыни, только по р. Атреку, близ персидской границы, лежит ковыльная степь, где туркмены занимаются хлебопашеством. Кочевники занимают пространство около полумиллиона квадратных верст, имеют только пастбища и пользуются водой из колодцев, часто солоноватой на вкус»[229].
В 1858 г., как отмечалось выше, было отправлено российское посольство в Хиву и Бухару во главе с полковником Н. П, Игнатьевым, В 1865 г. на завоеванной территории в составе Оренбургского генерал-губернаторства была создана Туркестанская область.
В этом же году генералом М. Г. Черняевым был взят штурмом Ташкент. Отряду в 1950 человек противостояли 30 тыс. защитников с 63-мя артиллерийскими орудиями.
Взятие Ташкента вызвало столкновения России с Бухарой. Бухарский эмир требовал вывода российских войск. Он назначил своим наместником Худояр-хана в Коканде. Была задержана российская миссия в Бухаре.
В 1866 г. бухарские вооруженные отряды подступали к Ташкенту, обстреливали российские пароходы Сырдарьинской флотилии. В ответ российские войска нанесли бухарцам поражение под Ирджаром. Штурмом были взяты Ходжент, Ура-Тюбе, Джизак и нанесено новое поражение бухарским войскам у Яны-Кургана[230].
В 1867 г. из земель, занятых Россией на юге Казахстана и в Кокандском ханстве, было организовано Туркестанское генерал-губернаторство в составе Сырдарьинской и Семиреченской областей с центром в Ташкенте. Первым генерал-губернатором, как уже сказано выше, был назначен генерал-губернатор К. П. Кауфман.
Бухарский эмир собрал значительные военные силы в Самарканде. К. П. Кауфман решил предупредить эмира и выступил в долину Зеравшана с отрядом в 8500 человек. 2 мая 1868 г. был занят Самарканд, затем Катта-Курган. Сильное поражение бухарские войска потерпели под Зерабулаком. В цитадели города был оставлен российский отряд в 658 человек, которому пришлось выдержать восьмидневную осаду 50900 бухарцев, потеряв 49 человек убитыми и 172 ранеными.
29 января 1868 г. К. П. Кауфман заключил мирный договор с кокандским ханом Худояром и 18 июня 1868 г. с бухарским эмиром.