В то время стало очень важно положение в Зарасай и его окрестностях. Это была одна из стратегически важных точек, от Зарасай сравнительно недалеко Вильнюс и совсем близко до Даугавпилса. А в окрестностях Зарасай было сосредоточено много советских военнослужащих. 4 июня произошли важные перемены – на собрание местных коммунистов создан новый ревком в составе трех членов. Ими стали Ю. Озарскис (председатель), Й. Груодис и И. Левин. Поскольку были большие проблемы с питанием военнослужащих, принято решение ревкома о реквизиции продуктов питания. Проблемы с питанием были быстро решены, военные начали получать нормальное количество хлеба, рыбы и других продуктов. Были созданы и группы Чрезвычайной комиссии, которые эффективно боролись с саботажем и другими негативными явлениями.
В это время ЦК КПЛ принимали важные решение насчет подпольной работы на тех территориях Литвы, которые уже заняты врагами. Кроме того, велись конкретные действия для усиление связи с прогрессивными немецкими военными (,спартаковцами” и др.). С ответственными задачами на занятые территории посланы А. Драбавичюте, В. Ясайтис, А. Якшявичюс, Й. Думша, К. Пожела и др.
Немецкие солдаты, ”спартаковцы” помогали разными способами. Они собирали важные данные и передавали их советским военным, передавали оружие, распространяли агитационные прокламации. Когда их действия засекали, они иногда переходили на сторону советских войск (так поступил Адолф Шель, Фридрих Шредер, Ханс Бекер и еще некоторые их коллеги). Были и случаи, когда «спартаковцы” агитировали своих друзей и переходили на советскую сторону целыми группами Так Курт Леске и Карл Ремер уговорили вместе с ними прейти еще 8 немецких солдат. 21 июня в Шауляй из Гамбурга прибыли 60, спартаковцев” с 3-мя бронемашинами. Они напали на местную тюрьму и освободили всех политзаключенных.
Буржуазные националисты и немецкие оккупанты и дальше опирались на белый террор. Были убиты активные коммунисты: С. Грибас (Шиаулей), В. Башкис, Й. Виткаускас (Паневежис), П. Мейлус, В. Климашевский (Укмерге), П.Стрепейка, К. Балтарагис (Йонишкелис) и еще много их соратников. Среди них были и коммунисты, комсомольцы, и члены их семьей, и представители прогрессивной интеллигенции, и люди, которые хотя и недолго работали в органах советской власти. Особо жестоко действовал отряд В. Григалюнаса-Гловацкиса в окрестностях Рокишкиса (их так называемый «военный суд» осудил с на смертную казнь свыше 100 человек), отряд П.Плехавичюса в Жемайтии (только в периоде с февраля по июнь 1919 г. каратели этого отряда убили свыше 70 человек), буржуазные националисты в окрестностях Йонишкелиса (убили около 30 человек).
Проводились и такие «Варфоломеевские ночи» – через одну ночь в городке Жеймялис убили 7 человек, в том числе члена местного Совета Б. Вайчюлиса, милиционеров И. Мартинайтиса и К. Купчюнаса. А их дома ограбили и подожгли. В районе Укмерге очень активным карателем был и ксендз городка Пагирей Р. Каминскас. По его указанию схваченный член отряда имени Р. Люксембург В. Войцеховский был привязан к дереву и сожжен. 8 июля отряд белых окружил деревню Сувеко (25 км от Зарасай). Они схватили местного коммуниста К. Наркявичюса и у него проживавшего профсоюзного деятеля из Рокишкиса С. Ашмонайтиса, оба были расстреляны. Затем они выгнали всех жителей деревни из своих домов, и подожгли. Вся деревня была сожжена.
В конце июля-начале августа в окрестностях Зарасай проходили активные бои. Противники посылали все новые военные формирование, они были хорошо вооружены, поскольку от немцев получили много военной техники, в том числе артиллерийские орудия, много пулеметов. 25 августа советские войска покинули Зарасай и отступили в территорию Латвии. Вся территория Литвы уже находилась под контролем белых. Хотя борьба за советскую власть была проиграна, но советские идеи и дальше активно распространялись в Литве. А многие коммунисты, прошедшие серьезное жизненное обучения в революционных событиях 1918–1919 г., дальше были крепкой опорой литовской компартии. Среди них К. Пожела, Ю. Грейфенбергерис, И. Гашка, П. Паярскис, К. Диджюлис, К.Гедрис, А. Каросас, П. Ботирюс, Ю. Витас и многие другие.
В первой половине 1920 года по Литве прокатилась новая волна белого террора. Вооруженные отряды крайних националистов под руководством П. Плехавичюса, В.Григалюнаса – Гловацкиса, Ю.Шараускаса и др. карателей, с января 1920 г. вели настоящую охоту на коммунистов, членов их семей, других жителей Литвы левой ориентации. Их убивали, некоторых заключали в тюрьмы и держали там в очень плохих условиях. В феврале 1920 г. в Каунасе вспыхнуло восстание солдат. Очень плохое питание и плохие условия проживание вынудили из к восстанию.