Новые истребители первой получила 309-я эскадрилья 1 июня 1942 года. Поскольку это была эскадрилья армейской поддержки, машины несли лишь одну букву. 20 октября 1944 года эскадрилья получила название истребительной и пересела на «Мустанги III». Новые машины несли обычные для того времени обозначения. Как и в других частях, в 309-й эскадрилье со временем появились машины без камуфляжа.
Тут будет уместным сообщить, что на счету 309-й эскадрильи три сбитых Me 262 из четырех, сбитых поляками на Западном фронте. Кроме 309-й эскадрильи на «Мустангах» летали 306-я эскадрилья (UZ) с 26 марта 1944 года, 315-я (РК) с 26 марта 1944 года и 316-я (SZ) с апреля 1944 года. Последней получил «Мустанги» (зато Mk IV) 303-я эскадрилья (RF, после войны PD) — 3 апреля 1945 года. «Мустанги» этой эскадрильи не имели клетчатой панели и эмблемы части.
Единственным отступлением от правил, на которое соглашалось командование RAF, было разрешение отмечать машины командиров эскадрилий, крыльев и групп. Командир крыла мог по желанию вместо идентификатора эскадрильи поместить свои инициалы. Например, на самолете Станислава Скальского перед кокардой находились две буквы SS, выполненные в том же стиле, что идентификатор 133-го крыла на остальных машинах. Встречались следующие инициалы: TN — Tadeusz Nowerski, JZ — Jan Zumbach, TR — Tadeusz Rolski и несколько других.
В конце войны было разрешено иностранным частям в составе RAF изменить английские опознавательные знаки на знаки национального образца. Этой возможностью воспользовались чехи. Польское же правительство в Лондоне к тому времени превратилось в политический труп, поэтому польские «Мустанги» остались как были.
Окраска «Мустангов» в USAAF
Прототип NA-73X остался неокрашенным. Он получил только опознавательные знаки в форме вертикальной темно-синей и горизонтальных красных и белых полос на руле направления. Два серийных самолета (четвертый и десятый), полученные из английской партии, несли на крыльях большие серийные номера. На хвостовом оперении и двигателе повторялись четыре последних цифры серийного номера и американские звезды. На фюзеляже вместо опознавательных знаков машины получили эмблему в виде стилизованной под стрелу надписи «WRIGHT». Перед кабиной проходила черная противобликовая полоса. Эту полосу позднее получил и прототип NA-73X. У прототипа на верхней стороне правого крыла и нижней стороне левого крыла имелась надпись «NX 19998», сделанная крупными черными литерами. ХР-51 получил те же обозначения, плюс к тому на нижней поверхности крыльев нанесли надпись «US ARMY», сделанную темно-синими (Insignia Blue) буквами. На машинах из английской партии на фюзеляже имелось изображение желтой буквы «Р», вписанной в круг того же цвета.