Рассказ предка

В двух местах, втором и пятом, имеются даже не два, а три варианта. Это составляет в общей сложности 16 "различий". Собрав список различий, мы определяем, какое дерево лучше всего их объясняет. Существует много способов сделать это, и все они могут быть использованы как для животных, так и для литературных текстов. Простейшим является группировка текстов на основе общей схожести. Он обычно основывается на некоторых вариантах следующего метода. Сначала мы устанавливаем пару наиболее близких текстов. Затем мы используем эту пару как единый усредненный текст и ставим рядом с оставшимися текстами, потом мы ищем следующую самую подобную пару. И так далее, составляя последовательно вложенные группы до тех пор, пока дерево родства не будет построено. Этот род техник - один из наиболее распространенных, известный как "neighbourjoining" - быстр при вычислениях, но не включает логики эволюционного процесса. Они – просто меры подобия. По этой причине, "кладистская" школа таксономии, которая глубоко эволюционна в своей основе (хотя не все ее члены это осознают) предпочитает другие методы, из которых первым разработанным был метод экономности.

Экономность, как мы видели в "Рассказе Орангутана", здесь значит экономность объяснения. В эволюции, не важно, животного или манускрипта, наиболее экономным объяснением является то, которое постулирует минимальное количество эволюционных изменений. Если два текста объединены общей чертой, экономное объяснение состоит в том, что они вместе унаследовали ее от общего предка, а не в том, что каждый развил ее независимо. Это далеко не неизменное правило, но это, во всяком случае, более вероятно, чем обратное. Метод экономности - по крайней мере в принципе - рассматривает все возможные деревья и выбирает то, которое минимизирует количество изменений.

Когда мы выбираем среди деревьев по экономности, некоторые виды различий нам не могут помочь. Различия, которые уникальны для единственного манускрипта или для единственного вида животного, неинформативны. Метод объединения соседей использует их, а метод экономности полностью их игнорирует. Экономность опирается на информативные изменения: те, что являются общими более чем для одного манускрипта. Предпочтительное дерево - это то, которое использует общее происхождение для объяснения стольких информативных различий, сколько возможно. В наших чосеровских строках существуют пять информативных различий. Четыре разделяют манускрипты на:

{""Британская Библиотека" + "Эджертон"} против {"Церковь Христа" + "Хенгрвт"}.

Эти различия выделены первой, третьей, седьмой и восьмой красной линией. Пятое, косая черта, выделенная двенадцатой красной линией, разделяет манускрипты по-другому, на:

{"Британская Библиотека" + "Хенгрвт"} против {"Церковь Христа" + "Эджертон"}.

Эти разделения противоречат друг другу. Мы не можем нарисовать никакого дерева, в котором каждое изменение случилось бы только однажды. Лучшее из тех, что мы можем создать, это следующее (заметьте, что это неукорененное дерево), которое минимизирует конфликт, требуя, чтобы косая черта появлялась и исчезала лишь дважды.

На самом деле, в данном случае у меня нет большой уверенности в моих предположениях. Конвергенции и реверсии часты в текстах, особенно когда смысл стиха не меняется. Средневековый писец, должно быть, не испытывал особых угрызений совести, меняя написание, и еще меньше при вставке или удалении знака препинания, такого как косая черта. Лучшим индикатором взаимоотношений будут такие изменения, как перестановка слов. Генетическими аналогами этого являются "редкие геномные изменения": такие события как крупные вставки, делеции и дупликации ДНК. Мы можем открыто учесть их, присвоив больший или меньший вес различным типам изменений. Те изменения, которые заведомо часты или ненадежны, понижаются в весе при подсчете дополнительных изменений. Заведомо редкие изменения или надежные показатели родства повышаются в весе. Повышенные веса изменений означает, что мы особенно не желаем считать их дважды. Наиболее экономное дерево в таком случае то, у которого наименьший общий вес.

Метод экономии широко используется для поиска эволюционных деревьев. Но если конвергенции и реверсии распространены - как в случае многих последовательностей ДНК, а также в нашем чосеровском тексте - экономность может вводить в заблуждение. Это проблема, известная под именем "притяжение длинных ветвей". Вот что это значит.

Кладограммы, укорененные и неукорененные, передают только порядок ветвлений. Филограммы или филогенетические деревья (греческое филон - раса, племя, класс) похожи, но кроме того используют длину ветвей для передачи информации. Обычно длины ветвей отражают эволюционное расстояние: длинные ветви представляют большие изменения, короткие - небольшие. Первая строка "Кентерберийских Рассказов" дает следующую филограмму: