После этого завоеванные земли начали заселяться европейцами, началось возведение церквей вдоль побережий Америки, Африки, Индии и Вест-Индии. Португальцы основали поселения вдоль берегов Западной Африки, Конго и Анголы, в Индии и на Цейлоне, избрав Гоа в качестве своей штаб-квартиры. Они обосновались в Бразилии и на острове Святой Елены, на острове Сокотра и в Мозамбике, в Ормузе в Персидском заливе, полуострове Малакка и островах Малайского архипелага, в Макао (1555) на южном побережье Китая. И даже там, где они не могли основать колонии, как в Японии, везде их торговые поселения имели небольшие церкви.
Испанцы в Северной Америке завоевали Мексику и острова Вест-Индии, всю Центральную Америку вплоть до Панамы, продвинулись в Северной Америке в Калифорнию и Нью-Мексико. В Южной Америке они завоевали Перу, Колумбию, Венесуэлу и Чили, продвинулись в бассейн реки Ла-Плата и далее на юг материка.
Только на Дальнем Востоке испанцы соперничали с португальцами. Поскольку кругосветная экспедиция Магеллана доказала в 1522 году, что Земля круглая (экспедиция под руководством Магеллана началась в 1519 году, в 1521 году Магеллан погиб на Филиппинах, завершилась экспедиция в 1522 году под руководством Элькано. —
Испанцы заявляли, что настоящая линия, обозначавшая португальскую и испанскую полусферы, проходит по Малакке и Гоа, а Филиппины, названные так в честь Филиппа II, относятся к Испании, как и открытые испанцами морские пути, тянущиеся на восток от Филиппин через Тихий океан к Мексике. Возникшему спору было суждено оказать гибельные последствия на христианскую историю Японии.
В то время считалось, что слова «цивилизованный» и «христианизированный» означают одно и то же. Благодаря образованным людям основывались епископства и монастыри, получавшие пожертвования. Построили и несколько школ, в 1544 году в Новом Свете появился первый университет — в Мехико. За ним последовали и учрежденные до 1600 года университеты в Лиме, Санто-Доминго и Боготе.
Первым приходом в Америке стал приход Санто-Доминго, устроенный в 1511 году, к 1582 году количество приходов увеличилось на пятнадцать, включая и те, что находились на Кубе, в Мексике, в Лиме, Кито, Сантьяго, Боготе и Буэнос-Айресе.
Христианская экспансия в Испанскую Америку напоминала каролингскую миссионерскую экспансию в Германии, происходившую за семьсот лет до этого, когда солдат оказывался сильнее священника. Миссионеры, часто набожные проповедники, сопровождали завоевателей, устраивали церкви и школы по пути их следования. Однако находившихся далеко от надзора центральных властей испанских искателей приключений не так легко было сдерживать, если они намеревались грабить и убивать.
Некоторые из них унаследовали то рвение времен испанских крестовых походов, которое позволило создать нацию в течение длительных лет сражений против мавров. Кортес, завоеватель Мексики, неразборчивый в средствах и развращенный во всех смыслах, обладал духом крестоносцев, он посвятил себя Деве Марии. Он всегда сохранял на себе Ее изображение, молился, ежедневно посещал мессу, на одном флаге разместил крест, на другом — герб Кастилии и изображение Девы Марии.
Подобные экспедиции предполагали одним из аспектов наличие истинных преемников средневекового крестового похода. Нам очевиден тот же самый фанатизм, благородство, суеверия, возможности совершения подвигов ради славы и ради добычи, имея в виду открытие новых земель для христианского мира.
Вместе с тем существовали два угрожающих различия, первое заключалось в том, что противостоявшие племена были слабыми и невоинственными. (Здесь автор ошибается. Испанцам, несмотря на их запредельное мужество, героизм, а также столь же безмерную отчаянную отвагу (переходящую в наглость и вероломство), завоевание многомиллионных империй ацтеков и инков, да и борьба с другими сильными племенами, такими как арауканцы, далось недешево. Гораздо труднее, чем англичанам и американцам, осуществлявшим геноцид действительно слабых индейцев Северной Америки к северу от Мексики. —
Однако, услышав о том, что испанцев собираются вырезать, и опасаясь этого в связи со своей малочисленностью, Кортес пригласил чолуланскую знать на священную территорию храма, где разместились его войска, и там, по сигналу, данному выстрелом из мушкета, было убито более 3000 собравшихся, и само действие заняло более двух часов.