К 1656 году в самом Гоа насчитывалось порядка 180 индийских священников. Их число явно было незначительным, и португальское правительство по-прежнему предвзято относилось к священникам-индусам. Однако препятствия к созданию местного духовенства были навсегда преодолены.
Таковы были основы для формирования новых церквей в Америке и Азии, и можно сказать, что католическая Европа активизировала широкое распространение христианской веры.
В этот период разделение христианского мира вряд ли мешало миссионерской деятельности. Но иногда, когда миссионеры доставлялись через моря, их оказывалось сложно уберечь в случаях политического или коммерческого соперничества стран, откуда они прибыли. Так, испанский командующий безжалостно убил 200 французских гугенотов на пляже Флориды, руководствуясь тем, что они были и французами, и гугенотами.
В Японии соперничество голландцев и англичан с португальцами способствовало катастрофе, которая захлестнула зародившуюся в Японии церковь. А в Северной Америке французские католические поселения в Канаде (Новая Франция) исключали законодательным образом гугенотов, но закон жестко не исполняли.
Усиление морского могущества англичан и голландцев в XVII веке позволило распространить европейское влияние и власть за отдаленные моря, вызвав неприязнь протестантов и католиков. Голландцы основали в 1619 году Батавию, захватили в 1641 году Малакку и к 1638 году Цейлон.
Вместе с англичанами они заняли вакуум, образовавшийся слабеющей Португалией (которая с 1581 по 1640 год была захвачена Испанией. Португальцы, освободившись, сумели отбить захваченные у них голландцами Бразилию, Анголу, но многое было потеряно безвозвратно. —
Поскольку многие иезуиты относились к великим азиатским религиям с пониманием, раньше или позже они неизбежно должны были соотнести их с христианским учением. Сам процесс несколько задержался, пока не отошла в прошлое Реформация и не пришел век Просвещения. Тогда сразу пришлось решить следующий вопрос — как раскрываемый закон соотносится с естественным правом. Как христианскую этику следовало отличать от естественного права. Или же следовало говорить о том, что вышеупомянутые религии Азии представляли собой частичное «откровение», пришедшее к людям, не являвшимся христианами.
Во время эпохи Реформации подобные проблемы обострились, когда Азия в значительной степени повернулась к христианской церкви. Маттео Риччи в Пекине начал понимать, что продолжительная история китайцев требовала обновления хронологии Ветхого Завета. Однако умы Европы вряд ли были затронуты этой проблемой вплоть до второй половины XVII века. Только в 1681 году Боссюэ написал свой «Дискурс всемирной истории», не выходя за пределы средиземноморского и европейского миров.
Некоторые из вопросов, которые озадачивали пытливые умы в XVI веке, оказались незначительными в свете будущей перспективы. Открытие шоколада принудило теологов, ради правил постящихся, определить, являлся ли он едой или жидкостью. Вскоре заподозрили, что шоколад не способствует целомудрию, и, наконец, его употребление запретили несколько религиозных орденов.
Отец Алонсо Санчес, путешествовавший из Филиппин в Макао, после своего прибытия попытался отслужить мессу в День святого Афанасия (2 мая) и удивился, обнаружив, что церкви Макао празднуют мессу в День обретения Святого Креста (3 мая) и что все не ошиблись в дате.
Вновь открытые племена американских индейцев, возможно, происходили от Адама, на самом же деле от Ноя в соответствии со Священным Писанием. Если все животные происходят от зверей с ковчега, то приходилось размышлять, как они пересекли океаны, добравшись до «Индий», то есть Америки. Возможно, через иезуита Акосту возможно было найти земной мост, по которому люди и животные смогли пройти, добравшись из Европы или Африки в Америку — в ее арктический или южноатлантический районы (поскольку миф об Атлантиде (то есть суше, существовавшей в Центральной Атлантике) отметался как нелепый).
Однако что делать с теми животными, которые обитали в Америке и не имели двойников в Европе? Если они происходят из ковчега на горе Арарат, почему такие виды не встречаются в Европе? Если все эти звери происходят от обитателей ковчега, то мы должны сделать вывод, что некоторые встречающиеся виды являются более приспособленными по своему образу жизни обитателями и покинули другие районы (или исчезли в них).
Акосту беспокоило, несмотря на совершенные путешествия вокруг света, отношение людей к древним Отцам Церкви или богословам, которые, опираясь на недостаточное количество данных, предположили, что Земля — плоская, считая, что оно не должно быть презрительным.