Едва оправившись от двух природных катастроф, Рим оказался целью планомерных атак лангобардского короля Агилульфа (591–616 гг.). Мирный договор Рима с лангобардами (598 г.) был заключен по инициативе и при деятельном участии понтифика. В 602 г. власть в Константинополе узурпировал Фока. Константинопольский патриарх Кириак отказался благословить его на царствование, и тогда Фока обратил свои взгляды на запад. В 607 г. он признал папу Бонифация III главой всех христианских церквей. Однако на самом деле Рим весь VII в. находился под сильным византийским влиянием. Даже избранного папу вплоть до 685 г. утверждал византийский император (позднее это право перешло к экзархам, византийским наместникам).
Кстати, большинство римских понтификов в этом столетии были греками или сирийцами. В понимании имперской власти глава государства стоял неизмеримо выше первосвященника. И это не было пустой догмой. Когда папа Мартин I воспротивился декрету императора Константа II по сугубо теологическому вопросу и даже публично осудил этот декрет (649 г.), отказавшись подчиняться экзарху, его судили в византийской столице, а потом сослали в Крым (653 г.), где понтифик и умер (655 г.).
В 663 г. Рим удостоился визита византийского императора. Констант II, правда, прибыл с сугубо практической целью. Осмотрев городские строения, он приказал снять с них весь металл, который можно было бы использовать в войнах с мусульманами.
Новая напряженность между папством и империей возникла во времена иконоборчества. В 727 г. папа Григорий II отказался исполнять эдикт императора Льва Исавра, направленный против поклонения иконам. Тогда император вызвал строптивого понтифика на суд в Константинополь (728 г.). Папа отказался; император решил добиться исполнения своего указа силой. Он конфисковал владения папы в Сицилии, а вслед за этим передал под контроль константинопольского патриарха все владения Римской церкви в границах империи. Неожиданно оставшемуся один на один с византийской державой понтифику пришел на помощь король лангобардов Лиутпранд. Он было предложил папе подписать союзный договор, но Григорий II отказался. Лангобарды захватили принадлежавший Римскому герцогству город Сутри и передали его под власть папы. На этом вроде бы и закончилась вся их помощь понтификам. Ну а Сутри стал первой ячейкой складывавшегося Папского государства. При папе Захарии (741–752 гг.) была произведена хозяйственная реорганизация территории вокруг Рима, где появились так называемые «культовые дома», настоящие сельскохозяйственные предприятия, подчиненные церкви. В их задачу входило обеспечение продовольственного снабжения Рима.
Пипин совершил два похода в Италию и передал папе ключи от 22 городов, Равеннский экзархат, Римское герцогство и Пентаполь (756 г.). Так папа стал светским государем. Это быстро деморализовало институт папства. Кроме того, и Стефану II, и его преемнику Павлу I пришлось защищаться не только от византийского императора и лангобардского короля, но и от собственной римской аристократии, прежде оказывавшей папе необходимую поддержку.
Сан понтифика оказался весьма привлекательным для герцогов и баронов, пожелавших сделать духовную власть игрушкой в руках светских правителей. Так, герцог Тотон хотел убить Павла I, а на престол возвести своего брата. На помощь опять пришли франки. В 774 г. Карл Великий вторгся в Северную Италию, низложил последнего лангобардского короля Дезидерия, а его владения присоединил к своему королевству. Одновременно Карл «приструнил» и римских аристократов.