На правительство США стали ктому времени оказывать мощное влияние сионистские организации, пополнившие свой состав за счет еврейских эмигрантов из России. А они составляли большинство среди тех 3,5 млн эмигрантов из России, которые прибыли в США с 1888 г. по 1905 г. Используя этот рычаг, Шифф сдержал свое слово. Как пишет «Еврейская энциклопедия», особую известность принёс Шиффу выпуск облигаций на сумму 200 млн долларов в пользу Японии во время русско-японской войны. «Он помог Японии, так как ненавидел царский режим за его антисемитскую политику». С 1901 г. администрация Теодора Рузвельта под нажимом сионистских организаций США оказывала финансовую и военно-техническую помощь Японии — основному противнику России на Дальнем Востоке. Теодор Рузвельт фактически поддержал Японию, а синдикат американских банков, организованный Дж. Шиффом, предоставил в 1904–1905 году Японии неограниченные займы и в то же самое время не допустил получения каких-либо займов правительством России. Одновременно были предприняты усилия с целью закрыть России доступ к западным кредитам в других странах помимо США. Это и предопределило поражение России в русско-японской войне. Тому факту, что к царю, России и православию Якоб Шифф испытывал лютую ненависть, немало подтверждений. Он так активно помогал Японии во время русско-японской войны 1905 г., что получил за это два японских ордена — редкий случай в этой стране.
О его поддержке российских революционеров говорят не только опека Шиффа над Троцким и Николаем Бухариным. По данным французской разведки, только через Шиффа российские революционеры в 1915-17 гг. получили на подрывную работу не менее 12 млн долларов, ($350 миллионов в пересчёте на 2007 год). Сам Шифф хвастался перед смертью, что он
Также заметьте, что Шифф организовал «Общество друзей русской свободы». «Целью этого общества, — говорится в бюллетене “Еврейского коммунального регистра”, — была агитация за свержение русского царя. Эти люди возвратились в Россию с готовностью участвовать в еврейской революции в России. Именно это “Общество” с помощью японцев проводило обучение около 50 тысяч русских военнопленных террористическим методам ведения подпольной борьбы и их идеологическую обработку. Таким образом, именно Якоб Шифф обеспечил необходимые для русской революции кадры и финансы». (См.: The Jewish (Communal Register of New York City. 1917–1918. Edited and published by Kehillah (Jewish community) of New York City. 356 Second Ave.)
Шифф неоднократно отказывался участвовать в займах для царского правительства и отговаривал от этого других финансистов. В то же время он оказывал щедрую помощь группам еврейской самообороны и жертвам погромов 1903–1905 гг. в Российской империи… Шифф сыграл видную роль в борьбе за денонсацию торгового договора между Россией и США от 1832 г. Лишь после февральской революции 1917 г. Шифф изменил своё отношение к России и, стремясь поддержать правительство Керенского, предоставил ему большой заем.
Биограф Шиффа Наоми Коэн показывает, что его отношение к царской России было «личной войной, продолжавшейся с 1890-х до 1917 года». Эта война, продолжает биограф, «с годами усиливалась и превращалась во всепоглощающую страсть». Причина — религиозная: «Банкир настойчиво сравнивал положение евреев в России с библейской историей Египетского исхода, а себя самого, без сомнения, видел новым Моисеем». Биограф считает, что именно своему «крестовому походу» против России Шифф обязан своему «возвышению на невиданную прежде для еврейского лидера высоту». Шифф влиял на решения правительства, на решения президента США…
Русский военный следователь по особо важным делам Борис Бразоль (1885–1963; «следователь от Бога», как его характеризовали), патриот России, занимавшийся расследованием злоупотреблений при поставках в армию, с 1916 года находился в командировке в США, где и остался после революции. В архиве Государственного департамента хранится его доклад «Большевизм и иудаизм», датированный 1918 годом, в котором утверждается: «Решение о свержении царского правительства было принято 14 февраля 1916 года в еврейском квартале Нью-Йорка группой революционеров во главе с банкиром Джейкобом Шиффом». На конференции было принято решение отправить в Россию несколько сот агитаторов из эмигрантской среды, для чего «нужная сумма, вне зависимости от её величины, будет предоставлена людьми, сочувствующими революции в России».