Жизненно важная оборона, которой византийцы прежде столь неосмотрительно пренебрегли в пользу наступательных действий, состояла на границах государства из трех родов войск. Основную роль играли акриты — пограничные военные поселенцы. Акриты знали толк и в земледелии, а в случае нападения врагов с луком и мечом в руках могли постоять за себя. Пример такого типичного полусказочного героя являет знаменитый эпос о Дигенисе, храбром, независимом воине. Как и у многих акритов, в нем смешалась кровь разных народов: его мать была христианкой, а отец — мусульманином и вождем. Подобные пограничники обладали большим опытом ведения партизанской войны. Их земли и пастбища освобождались от налогов, государство платило им жалованье. Акриты обычно несли службу по месту своего проживания. Так что защита границы означала для них охрану собственных владений, домов, семей. Нередко акриты и сами отправлялись в набеги, пограбить турецкие земли.
Кроме того, в приграничных областях были разбросаны крепости, гарнизонную службу в которых несли наемники из греков и иноземцев (франков, армян, славян, тюрок). Немалую роль играла «скификон» — легкая конница, главным образом, из метких лучников-сельчуков.
Наконец, к обороне привлекали и стратиотов — конных и пеших воинов из местных свободных крестьян — «эллиникон», организованных во вновь возрожденной системе фем. В отличие от акритов они принимали участие и в далеких военных походах. Заимствуя достижения Запада, византийских тяжелых кавалеристов — «латиникон» или «италикон» снабдили взамен круглых продолговатыми щитами и еще более длинными, чем прежде копьями, а наряду с лучниками появился корпус арбалетчиков, чьи короткие тяжелые стрелы, похожие на заостренные металлические болты, за триста шагов пробивали самые крепкие стальные панцири.
Феодор I в короткий срок собрал в северо-западной части Малой Азии значительный фонд земель, которые и составили основу его могущества. Не имея денег, император только пронией мог наградить своих сторонников за верную службу и поддержку. Однако выдавалась она только на срок жизни, с условием несения службы государю. Создавая бронированное войско каваллариев, василевс уменьшил число иноземцев-наемников, достигавшее трети армии, за счет вотчинников-прониаров и тем повысил боевой дух армии. Воины Ласкариса погибали, но не сдавались, проявляя редкостное мужество, — качество, которым ромеи не блистали еще несколько лет назад.
Как и при Комнинах, широко практиковалась опора на родственный императору узкий клан, в руках которого оказались важнейшие посты государства. Допуск в ряды родственников монарха был знаком особого благоволения и давался только самым преданным. В то время окрепли и выросли новые аристократические фамилии: Синадины, Тарханиоты, Макрины, Стасины. Но собственно правительство фактически сократилось до пределов царского дома и его секретариата. Это станет нормой византийского имперского управления на оставшиеся столетия.