Приняты пятнадцать российско-японских документов в различных областях двусторонних связей. Среди них подписанные В.В.Путиным и Ё.Мори Программа углубления сотрудничества в торгово-экономической области между Россией и Японией и Совместное заявление о взаимодействии России и Японии в международных делах. Подобный документ, суммирующий общие подходы сторон к актуальным международным проблемам, подготовлен впервые в практике российско-японского диалога. Подписаны также новые межправительственные соглашения о научно-техническом сотрудничестве и о культурных связях, Меморандум о создании и деятельности на территории России японских центров по техническому содействию проводимым в России реформам, Меморандум о развитии сотрудничества в области содействия разоружению, нераспространению и утилизации ядерных вооружений, подлежащих сокращению в Российской Федерации, Протокол о дополнениях к соглашению о предотвращении инцидентов на море за пределами территориальных вод от 13 октября 1993 г. и др. Впервые на документальную основу были поставлены связи между пограничными службами и правоохранительными органами России и Японии: подписаны межправительственный Меморандум о сотрудничестве в правоохранительной области и Меморандум об основах развития сотрудничества между ФПС России и Управлением безопасности на море Японии.
Важное место в ходе переговоров заняла тема дальнейшего развития российско-японского торгово-экономического сотрудничества. С японской стороны было подтверждено, что деловые круги Японии в долгосрочной перспективе рассматривают Россию как многообещающий рынок и стратегически заинтересованы в активизации сотрудничества с Россией, прежде всего в освоении энергоресурсов Сибири и Дальнего Востока. В то же время было обращено внимание на имеющуюся, по мнению Правительства и деловых кругов Японии, необходимость дальнейшего улучшения инвестиционного климата в России, решения ряда проблем, сдерживающих развитие двустороннего экономического сотрудничества (пробуксовка с реализацией ряда инвестиционных проектов в рамках японских кредитных линий и др.). С российской стороны был выдвинут целый ряд новых крупных идей, реализация которых позволила бы придать российско-японскому экономическому сотрудничеству качественно новое, более масштабное измерение. Речь идет о строительстве "Энергомоста Россия-Япония" с целью экспорта в Японию электроэнергии, строительстве тоннелей Япония-Сахалин-материковая часть России, что позволило бы создать прямое железнодорожное сообщение Японии с Европой через Транссиб, прокладке магистральных газопроводов из России в Японию и ряде других инициатив.
Было подчеркнуто, что российская сторона будет держать на контроле решение проблемных вопросов российско-японских экономических связей.
Обсуждение международной проблематики показало растушую близость подходов России и Японии к актуальным мировым проблемам. Это позволяет говорить о том, что именно в сфере взаимодействия в международных делах сейчас наиболее ярко проявляются элементы партнерства в российско-японских отношениях.
Стороны были едины в необходимости продвижения процесса ядерного разоружения, укрепления режима нераспространения ядерного оружия. В данной связи выражено обоюдное намерение способствовать присоединению к ДВЗЯИ и ДНЯО Индии и Пакистана.
Отмечена важность взаимодействия сторон в укреплении стабильности на Корейском полуострове. Подчеркнута необходимость реформирования ООН и ее Совета Безопасности таким образом, чтобы это способствовало укреплению центральной роли ООН в поддержании международного мира и повышению эффективности деятельности Организации. С японской стороны была высказана глубокая признательность за выраженную Президентом России поддержку кандидатуры Японии в постоянные члены СБ ООН.
Состоялось обстоятельное и откровенное обсуждение проблемы мирного договора, включая аспект пограничного размежевания. По итогам подписано Заявление Президента России и Премьер-министра Японии по проблеме мирного договора. В нем отмечается, что после Красноярской договоренности от ноября 1997 г. ("приложить максимум усилий с целью заключения мирного договора к 2000 году") был достигнут целый ряд позитивных результатов, в частности, в плане углубления связей и контактов в районе южных Курил (реализуется соглашение о японском рыболовном промысле в районе островов, выполняется договоренность о посещениях островов по максимально упрощенной процедуре японскими гражданами – их бывшими жителями и др.). Наряду с этим признано необходимым продолжить усилия по реализации Красноярской договоренности и закреплению ее позитивных результатов. Высказано обоюдное согласие продолжить переговоры