К революционному 1917 году многие месторождения полезных ископаемых располагались на юге, в частности залежи железной руды, но ни одно из них не разрабатывалось и не было ни одной попытки организовать сталелитейную промышленность. Месторождения меди разрабатывались в Ферганской долине, у Чирчика близ Ташкента, а также в Бухарском эмирате. В 1870 году медь, добывавшаяся близ Намангана в Ферганской долине, использовалась на медеплавильных заводах, работавших на местном угле. Однако большая часть медной руды отправлялась на медеплавильные заводы Москвы и Риги после обогащения на местных фабриках. В 1911 году было добыто 2700 тонн (170 тыс. пудов) медной руды. Одним из немногих металлов, добываемых местными жителями, был свинец, который использовали для изготовления ружейных пуль. В горах Каратау к северу от города Туркестан разработками свинца владел хан Коканда, но добывались лишь лучшие сорта руд, поскольку примитивные методы выплавки были неэффективны. Во время военного вторжения России месторождения эксплуатировались на полную мощность. Русский купец купил их, чтобы снабжать русскую армию свинцовыми пулями, однако в начале 1870 года добыча свинца прекратилась. На юге Средней Азии были найдены марганец, цинк и сурьма, но ни одно из месторождений не разрабатывалось. В Ферганской долине добывали некоторое количество ванадия и радия, отправляя их в Россию.
Одним из главных соблазнов, привлекавших русских в Западный и Восточный Туркестан со времени Петра Великого, была мечта о наличии там в больших количествах золота. Слухи о нем обязаны хвастовству местных жителей и отчасти тому, что в Оренбург и Томск в период между 1748 и 1755 годами привозилось большое количество золотых и серебряных монет и слитков. Как оказалось, эти сокровища были разграблены из казны убитого правителя династии Афшаров в Персии Надир-шаха (пр. 1736–1747). Повлияло это обстоятельство на поведение русских или нет, но они обнаружили лишь небольшие, не оправдавшие надежд хранилища золота.
Среди минералов наиболее важной для экономики была соль. Ее месторождения разрабатывались во многих районах от Казахстана до Бухары. В производстве соли были заняты в 1915 году 2500 постоянных и 5200 сезонных рабочих. Разрабатывались также месторождения серы и селитры, главным образом в Кокандском ханстве, вначале для изготовления пороха, а позднее для поставок на спичечную фабрику в Ташкенте.
Переработка и перевозка продуктов сельского хозяйства
До 1917 года не было предпринято никаких инициатив по индустриализации Средней Азии. Горная промышленность находилась в зачаточном состоянии, производство угля и нефти – на элементарном уровне, железо и сталь не производились вовсе. Бухарский эмират даже не обследовали должным образом для оценки его полезных ископаемых, за исключением некоторых изысканий на золото в южном горном районе.
Как и в случае со степными областями, переработка сельскохозяйственного сырья, в частности хлопка, представляла собой основу промышленного производства. Две первые хлопкоочистительные машины были установлены в Коканде частными предпринимателями в 1880 году, а к 1890 году их число в Ферганской области достигло 21, увеличившись к 1901 году до 100. В 1914 году в области насчитывалось 159 хлопкоочистительных заводов, что являло собой высокую концентрацию индустрии очистки хлопка до 1917 года. В том же году в Самаркандской области работало 33 хлопкоочистительных завода, а в Сырдарьинской области 28. В Закаспийской области было более 10 заводов, включая два государственных предприятия в Мургабском имперском владении, однако Семиречье не располагало хлопкоочистительными предприятиями вовсе. В 1910 году в Бухарском эмирате действовали около 15 хлопкоочистительных заводов. Они располагались в таких местах, как Новая Бухара (Каган), Чарджоу, Карки и Термез. Бухарские власти потребовали строить все хлопкоочистительные заводы в двух верстах (около 1,3 мили) от железной дороги, что ограничивало развитие промышленности. В 1914 году в Ферганской области функционировали 19 заводов по производству хлопкового масла. Самые крупные из них, в Коканде и в Катта-Кургане, производили в год 45 тыс. тонн (2 млн 800 тыс. пудов) хлопкового масла. Обработка хлопка обеспечивала высокую занятость в Туркестанском крае. Из общего числа 20 925 промышленных рабочих в 1914 году 7628, или 36,5 %, были заняты на хлопкоочистительном производстве и 1720, или 8,2 %, на предприятиях по производству хлопкового масла.